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R broom glance.survreg 看一眼 survreg 對象


Glance 接受模型對象並返回 tibble::tibble(),其中僅包含一行模型摘要。摘要通常是擬合優度度量、殘差假設檢驗的 p 值或模型收斂信息。

Glance 永遠不會返返回自對建模函數的原始調用的信息。這包括建模函數的名稱或傳遞給建模函數的任何參數。

Glance 不計算匯總度量。相反,它將這些計算外包給適當的方法並將結果收集在一起。有時擬合優度測量是不確定的。在這些情況下,該度量將報告為 NA

無論模型矩陣是否秩虧,Glance 都會返回相同的列數。如果是這樣,則不再具有明確定義值的列中的條目將使用適當類型的 NA 進行填充。

用法

# S3 method for survreg
glance(x, ...)

參數

x

survival::survreg() 返回的 survreg 對象。

...

附加參數。不曾用過。僅需要匹配通用簽名。注意:拚寫錯誤的參數將被吸收到 ... 中,並被忽略。如果拚寫錯誤的參數有默認值,則將使用默認值。例如,如果您傳遞 conf.lvel = 0.9 ,所有計算將使用 conf.level = 0.95 進行。這裏有兩個異常:

  • tidy() 方法在提供 exponentiate 參數時會發出警告(如果該參數將被忽略)。

  • augment() 方法在提供 newdata 參數時會發出警告(如果該參數將被忽略)。

恰好隻有一行和一列的 tibble::tibble()

AIC

模型的 Akaike 信息準則。

BIC

模型的貝葉斯信息準則。

df

模型使用的自由度。

df.residual

剩餘自由度。

iter

算法/擬合過程的迭代已完成。

logLik

模型的對數似然。 [stats::logLik()] 可能是一個有用的參考。

nobs

使用的觀察數。

p.value

對應於檢驗統計量的 P 值。

statistic

卡方統計量。

例子


# load libraries for models and data
library(survival)

# fit model
sr <- survreg(
  Surv(futime, fustat) ~ ecog.ps + rx,
  ovarian,
  dist = "exponential"
)

# summarize model fit with tidiers + visualization
tidy(sr)
#> # A tibble: 3 × 5
#>   term        estimate std.error statistic     p.value
#>   <chr>          <dbl>     <dbl>     <dbl>       <dbl>
#> 1 (Intercept)    6.96      1.32      5.27  0.000000139
#> 2 ecog.ps       -0.433     0.587    -0.738 0.461      
#> 3 rx             0.582     0.587     0.991 0.322      
augment(sr, ovarian)
#> # A tibble: 26 × 9
#>    futime fustat   age resid.ds    rx ecog.ps .fitted .se.fit .resid
#>     <dbl>  <dbl> <dbl>    <dbl> <dbl>   <dbl>   <dbl>   <dbl>  <dbl>
#>  1     59      1  72.3        2     1       1   1224.    639. -1165.
#>  2    115      1  74.5        2     1       1   1224.    639. -1109.
#>  3    156      1  66.5        2     1       2    794.    350.  -638.
#>  4    421      0  53.4        2     2       1   2190.   1202. -1769.
#>  5    431      1  50.3        2     1       1   1224.    639.  -793.
#>  6    448      0  56.4        1     1       2    794.    350.  -346.
#>  7    464      1  56.9        2     2       2   1420.    741.  -956.
#>  8    475      1  59.9        2     2       2   1420.    741.  -945.
#>  9    477      0  64.2        2     1       1   1224.    639.  -747.
#> 10    563      1  55.2        1     2       2   1420.    741.  -857.
#> # ℹ 16 more rows
glance(sr)
#> # A tibble: 1 × 9
#>    iter    df statistic logLik   AIC   BIC df.residual  nobs p.value
#>   <int> <int>     <dbl>  <dbl> <dbl> <dbl>       <int> <int>   <dbl>
#> 1     4     3      1.67  -97.2  200.  204.          23    26   0.434

# coefficient plot
td <- tidy(sr, conf.int = TRUE)

library(ggplot2)

ggplot(td, aes(estimate, term)) +
  geom_point() +
  geom_errorbarh(aes(xmin = conf.low, xmax = conf.high), height = 0) +
  geom_vline(xintercept = 0)

相關用法


注:本文由純淨天空篩選整理自大神的英文原創作品 Glance at a(n) survreg object。非經特殊聲明,原始代碼版權歸原作者所有,本譯文未經允許或授權,請勿轉載或複製。