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R broom glance.cch 瀏覽 a(n) cch 對象


Glance 接受模型對象並返回 tibble::tibble()，其中僅包含一行模型摘要。摘要通常是擬合優度度量、殘差假設檢驗的 p 值或模型收斂信息。

Glance 永遠不會返返回自對建模函數的原始調用的信息。這包括建模函數的名稱或傳遞給建模函數的任何參數。

Glance 不計算匯總度量。相反，它將這些計算外包給適當的方法並將結果收集在一起。有時擬合優度測量是不確定的。在這些情況下，該度量將報告為 NA 。

無論模型矩陣是否秩虧，Glance 都會返回相同的列數。如果是這樣，則不再具有明確定義值的列中的條目將使用適當類型的 NA 進行填充。

用法

# S3 method for cch
glance(x, ...)

參數

x

從 survival::cch() 返回的 cch 對象。

...

附加參數。不曾用過。僅需要匹配通用簽名。注意：拚寫錯誤的參數將被吸收到 ... 中，並被忽略。如果拚寫錯誤的參數有默認值，則將使用默認值。例如，如果您傳遞 conf.lvel = 0.9 ，所有計算將使用 conf.level = 0.95 進行。這裏有兩個異常：

  • tidy() 方法在提供 exponentiate 參數時會發出警告(如果該參數將被忽略)。

  • augment() 方法在提供 newdata 參數時會發出警告(如果該參數將被忽略)。

值

恰好隻有一行和一列的 tibble::tibble()：

iter

算法/擬合過程的迭代已完成。

p.value

對應於檢驗統計量的 P 值。

rscore

強大的 log-rank 統計數據

score

分數。

n

預測數量

nevent

事件數量

例子


# load libraries for models and data
library(survival)

# examples come from cch documentation
subcoh <- nwtco$in.subcohort
selccoh <- with(nwtco, rel == 1 | subcoh == 1)
ccoh.data <- nwtco[selccoh, ]
ccoh.data$subcohort <- subcoh[selccoh]

# central-lab histology
ccoh.data$histol <- factor(ccoh.data$histol, labels = c("FH", "UH"))

# tumour stage
ccoh.data$stage <- factor(ccoh.data$stage, labels = c("I", "II", "III", "IV"))
ccoh.data$age <- ccoh.data$age / 12 # age in years

# fit model
fit.ccP <- cch(Surv(edrel, rel) ~ stage + histol + age,
  data = ccoh.data,
  subcoh = ~subcohort, id = ~seqno, cohort.size = 4028
)

# summarize model fit with tidiers + visualization
tidy(fit.ccP)
#> # A tibble: 5 × 7
#>   term     estimate std.error statistic  p.value conf.low conf.high
#>   <chr>       <dbl>     <dbl>     <dbl>    <dbl>    <dbl>     <dbl>
#> 1 stageII    0.735     0.168       4.36 1.30e- 5  0.404      1.06  
#> 2 stageIII   0.597     0.173       3.44 5.77e- 4  0.257      0.937 
#> 3 stageIV    1.38      0.205       6.76 1.40e-11  0.983      1.79  
#> 4 histolUH   1.50      0.160       9.38 0         1.19       1.81  
#> 5 age        0.0433    0.0237      1.82 6.83e- 2 -0.00324    0.0898

# coefficient plot
library(ggplot2)

ggplot(tidy(fit.ccP), aes(x = estimate, y = term)) +
  geom_point() +
  geom_errorbarh(aes(xmin = conf.low, xmax = conf.high), height = 0) +
  geom_vline(xintercept = 0)

相關用法


注：本文由純淨天空篩選整理自等大神的英文原創作品 Glance at a(n) cch object。非經特殊聲明，原始代碼版權歸原作者所有，本譯文未經允許或授權，請勿轉載或複製。