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Python Molecule.resetMolecule方法代码示例

本文整理汇总了Python中molecule.Molecule.resetMolecule方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Molecule.resetMolecule方法的具体用法?Python Molecule.resetMolecule怎么用?Python Molecule.resetMolecule使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在molecule.Molecule的用法示例。


在下文中一共展示了Molecule.resetMolecule方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: Template

# 需要导入模块: from molecule import Molecule [as 别名]
# 或者: from molecule.Molecule import resetMolecule [as 别名]
#end of file creation/manipulation module

#write the files
try:
    #assemble input
    #the template should be static, as the periodic table
    template    = Template()
    molecule    = Molecule(mol_input)
    scf         = Scf(scf_input, molecule.atoms)

    #if we are runing an inptest, call dirac and change the molecule
    if scf.getModule(template.dirac).getProperty(template, template.inptest):
        dirac = Dirac(scf_file_name, mol_file_name, molecule)
        dirac.run()
        #get the output of running Dirac and reset the molecule
        molecule.resetMolecule(dirac.parse())
        #remove the inptest and continue with the calculations
        scf.getModule(template.dirac).removeProperty(template.inptest)

#print the description of each atom
    for atom in molecule.atoms:
        atom.print_mol_file(output_path)
        atom.print_inp_file(periodic_table, scf, template, output_path)

#assemble output of the main files
#1.london
    #1.1 the london file
    london = London(scf, molecule)
    # a master j file
    j_london = J(scf, molecule)
开发者ID:EzequielBarboza,项目名称:sci_converter,代码行数:32,代码来源:main.py


注:本文中的molecule.Molecule.resetMolecule方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。