本文整理汇总了Python中molecule.Molecule.resetMolecule方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Molecule.resetMolecule方法的具体用法？Python Molecule.resetMolecule怎么用？Python Molecule.resetMolecule使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类molecule.Molecule的用法示例。
在下文中一共展示了Molecule.resetMolecule方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: Template
# 需要导入模块: from molecule import Molecule [as 别名]
# 或者: from molecule.Molecule import resetMolecule [as 别名]
#end of file creation/manipulation module
#write the files
try:
#assemble input
#the template should be static, as the periodic table
template = Template()
molecule = Molecule(mol_input)
scf = Scf(scf_input, molecule.atoms)
#if we are runing an inptest, call dirac and change the molecule
if scf.getModule(template.dirac).getProperty(template, template.inptest):
dirac = Dirac(scf_file_name, mol_file_name, molecule)
dirac.run()
#get the output of running Dirac and reset the molecule
molecule.resetMolecule(dirac.parse())
#remove the inptest and continue with the calculations
scf.getModule(template.dirac).removeProperty(template.inptest)
#print the description of each atom
for atom in molecule.atoms:
atom.print_mol_file(output_path)
atom.print_inp_file(periodic_table, scf, template, output_path)
#assemble output of the main files
#1.london
#1.1 the london file
london = London(scf, molecule)
# a master j file
j_london = J(scf, molecule)