本文整理汇总了Python中molecule.Molecule.converttoB方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Molecule.converttoB方法的具体用法？Python Molecule.converttoB怎么用？Python Molecule.converttoB使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类molecule.Molecule的用法示例。
在下文中一共展示了Molecule.converttoB方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: open
# 需要导入模块: from molecule import Molecule [as 别名]
# 或者: from molecule.Molecule import converttoB [as 别名]
import sys
import os
import subprocess
sys.path.insert(0, '../../0/oliviabern')
from molecule import Molecule
sys.path.insert(0, '../../extra-files')
from masses import mass
sys.path.insert(1, '../../1/oliviabern')
from freq import frequencies
#build molecule object
geom_string = open('../../extra-files/molecule.xyz').read()
mol = Molecule(geom_string)
atoms, xyz = mol.atoms, mol.xyz
mol.converttoB()
#atoms, xyz = mol.atoms, mol.xyz
#atoms , xyz = mol.read(geom_string)
m = str(mol)
m = m.splitlines()
N = int(m[0])
def inputform(atoms, xyz):
line_form = '{:2s} {: >15.10f} {: >15.10f} {: >15.10f}\n'
out = '{:10s}\n'.format('units Bohr')
for i in range(N):
out += line_form.format(atoms[i] , *xyz[i])
return out