本文整理汇总了Python中molecule.Molecule.add方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Molecule.add方法的具体用法?Python Molecule.add怎么用?Python Molecule.add使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类molecule.Molecule
的用法示例。
在下文中一共展示了Molecule.add方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: read_molecule
# 需要导入模块: from molecule import Molecule [as 别名]
# 或者: from molecule.Molecule import add [as 别名]
def read_molecule(r):
""" (reader) -> Molecule
Read a single molecule from r and return it,
or return None to signal end of file.
"""
# If there isn't another line, we're at the end of the file.
line = r.readline()
if not line:
return None
# Name of the molecule: "COMPND name"
key, name = line.split()
# Other lines are either "END" or "ATOM num kind x y z"
molecule = Molecule(name)
reading = True
while reading:
line = r.readline()
if line.startswith('END'):
reading = False
else:
key, num, kind, x, y, z = line.split()
molecule.add(Atom(num, kind, float(x), float(y), float(z)))
return molecule