本文整理汇总了Python中molecule.Molecule.addAtom方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Molecule.addAtom方法的具体用法？Python Molecule.addAtom怎么用？Python Molecule.addAtom使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类molecule.Molecule的用法示例。
在下文中一共展示了Molecule.addAtom方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: parse_lines
# 需要导入模块: from molecule import Molecule [as 别名]
# 或者: from molecule.Molecule import addAtom [as 别名]
def parse_lines():
#f = open(filename,'r')
isParsing = True
mol = None
line_counter = 0
n_atoms = 0
mol = Molecule("")
title = ""
to_angs = False
datas = []
for line in fileinput.input():
data = line.split()
if isParsing:
line_counter += 1
if line_counter == 1: n_atoms = int(data[0])
if line_counter == 2:
uline = line.upper()
to_angs = "AU" in uline
if line_counter > 2:
toangs = 1.0
if to_angs: toangs = 0.529177249
char = data[0]
data = map(float, data[1:])
atom = Atom(char, data[0]*toangs, data[1]*toangs, data[2]*toangs)
if mol is not None:
mol.addAtom(atom)
#f.close()
return mol