本文整理汇总了Python中molecule.Molecule.__init__方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Molecule.__init__方法的具体用法？Python Molecule.__init__怎么用？Python Molecule.__init__使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类molecule.Molecule的用法示例。
在下文中一共展示了Molecule.__init__方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: __init__
# 需要导入模块: from molecule import Molecule [as 别名]
# 或者: from molecule.Molecule import __init__ [as 别名]
def __init__(self, name=None, ff=None, sym=False, g_settings=None, m_settings=None, multipoles=None, ls_jobs=['w', 'non-w']):
GM_logger.info("Creating MoleculeOnGrid instance")
Molecule.__init__(self, name=name, ff=ff, sym=sym, settings=m_settings, multipoles=multipoles)
self.grid = grid.Grid(molecule_name=name, settings=g_settings)
self.grid_coordinates = self.grid.get_coordinates()
reference = {}
reference['non-w'] = self.grid.get_properties(property_name='esp', theory='reference')
try:
reference['w']= reference['non-w']*np.sqrt(self.grid.weights)
except AttributeError:
pass
self.A = {}
self.set_A(ls_jobs)
self.LS = {}
for key, A in self.A.items():
self.LS[key] = LeastSquares(name=key, A=A, b=reference[key])