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Python Raw._data[meg_channels,:]方法代码示例

本文整理汇总了Python中mne.io.Raw._data[meg_channels,:]方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python Raw._data[meg_channels,:]方法的具体用法?Python Raw._data[meg_channels,:]怎么用?Python Raw._data[meg_channels,:]使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在mne.io.Raw的用法示例。


在下文中一共展示了Raw._data[meg_channels,:]方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: clean_data

# 需要导入模块: from mne.io import Raw [as 别名]
# 或者: from mne.io.Raw import _data[meg_channels,:] [as 别名]
    def clean_data(self, fn_raw, W_orig, A_orig, idx_keep,
                   meg_channels=[]):

        # import necessary modules
        from mne import pick_types
        from mne.io import Raw

        # load data and get indices of MEG channel
        meg_raw = Raw(fn_raw, preload=True)
        if not np.any(meg_channels):
            meg_channels = pick_types(meg_raw.info, meg=True, eeg=False,
                                      eog=False, stim=False, exclude='bads')

         # transform data into FFT- and ICA-space
        meg_data = meg_raw._data[meg_channels, :]
        fft_data = np.fft.fft(meg_data.astype(np.complex64))

        # normalize data
        fftsize = fft_data.shape[1]
        fft_data = (fft_data - np.dot(np.ones((fftsize, 1)), self.dmean).transpose()) / \
                   np.dot(np.ones((fftsize, 1)), self.dstd).transpose()

        act = np.dot(W_orig, fft_data)

        # remove ICs related to signal-of-interest
        A_clean = A_orig.copy()

        idx_zero = range(A_clean.shape[1])
        idx_zero = np.setdiff1d(idx_zero, idx_keep)
        A_clean[:, idx_zero] = 0

        # transform data back into FFT- and MEG-space
        # fft_data = np.dot(A_clean, act)
        fft_data = np.dot(A_clean, act) * np.dot(np.ones((fftsize, 1)), self.dstd).transpose() + \
                   np.dot(np.ones((fftsize, 1)), self.dmean).transpose()
        meg_raw._data[meg_channels, :] = np.fft.ifft(fft_data).real

        # save cleaned data object
        fn_fourierICA = fn_raw[:fn_raw.rfind('-raw.fif')] + ',fourierICA-raw.fif'
        meg_raw.save(fn_fourierICA, overwrite=True)
开发者ID:dongqunxi,项目名称:jumeg,代码行数:42,代码来源:fourier_ica.py


注:本文中的mne.io.Raw._data[meg_channels,:]方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。