当前位置: 首页>>代码示例 >>用法及示例精选 >>正文

R broom tidy.clm 整理 a(n) clm 对象


Tidy 总结了有关模型组件的信息。模型组件可能是回归中的单个项、单个假设、聚类或类。 tidy 所认为的模型组件的确切含义因模型而异，但通常是不言而喻的。如果模型具有多种不同类型的组件，您将需要指定要返回哪些组件。

用法

# S3 method for clm
tidy(
  x,
  conf.int = FALSE,
  conf.level = 0.95,
  conf.type = c("profile", "Wald"),
  exponentiate = FALSE,
  ...
)

参数

x

从 ordinal::clm() 返回的 clm 对象。

conf.int

逻辑指示是否在整理的输出中包含置信区间。默认为 FALSE 。

conf.level

用于置信区间的置信水平(如果 conf.int = TRUE )。必须严格大于 0 且小于 1。默认为 0.95，对应于 95% 的置信区间。

conf.type

是否使用 "profile" 或 "Wald" 置信区间，传递给 ordinal::confint.clm() 的 type 参数。默认为 "profile" 。

exponentiate

逻辑指示是否对系数估计值取幂。这对于逻辑回归和多项回归来说是典型的，但如果没有 log 或 logit 链接，那么这是一个坏主意。默认为 FALSE 。

...

附加参数。不曾用过。仅需要匹配通用签名。注意：拼写错误的参数将被吸收到 ... 中，并被忽略。如果拼写错误的参数有默认值，则将使用默认值。例如，如果您传递 conf.lvel = 0.9 ，所有计算将使用 conf.level = 0.95 进行。这里有两个异常：

  • tidy() 方法在提供 exponentiate 参数时会发出警告(如果该参数将被忽略)。

  • augment() 方法在提供 newdata 参数时会发出警告(如果该参数将被忽略)。

细节

在 broom 0.7.0 中， coefficient_type 列已重命名为 coef.type ，并且内容也发生了更改。

注意，intercept类型系数对应于alpha参数，location类型系数对应于beta参数，并且scale类型系数对应于zeta参数。

值

带有列的 tibble::tibble()：

conf.high

估计置信区间的上限。

conf.low

估计置信区间的下限。

estimate

回归项的估计值。

p.value

与观察到的统计量相关的两侧 p 值。

statistic

在回归项非零的假设中使用的 T-statistic 的值。

std.error

回归项的标准误差。

term

回归项的名称。

例子


# load libraries for models and data
library(ordinal)

# fit model
fit <- clm(rating ~ temp * contact, data = wine)

# summarize model fit with tidiers
tidy(fit)
#> # A tibble: 7 × 6
#>   term                estimate std.error statistic  p.value coef.type
#>   <chr>                  <dbl>     <dbl>     <dbl>    <dbl> <chr>    
#> 1 1|2                   -1.41      0.545    -2.59  9.66e- 3 intercept
#> 2 2|3                    1.14      0.510     2.24  2.48e- 2 intercept
#> 3 3|4                    3.38      0.638     5.29  1.21e- 7 intercept
#> 4 4|5                    4.94      0.751     6.58  4.66e-11 intercept
#> 5 tempwarm               2.32      0.701     3.31  9.28e- 4 location 
#> 6 contactyes             1.35      0.660     2.04  4.13e- 2 location 
#> 7 tempwarm:contactyes    0.360     0.924     0.389 6.97e- 1 location 
tidy(fit, conf.int = TRUE, conf.level = 0.9)
#> # A tibble: 7 × 8
#>   term  estimate std.error statistic  p.value conf.low conf.high coef.type
#>   <chr>    <dbl>     <dbl>     <dbl>    <dbl>    <dbl>     <dbl> <chr>    
#> 1 1|2     -1.41      0.545    -2.59  9.66e- 3   NA         NA    intercept
#> 2 2|3      1.14      0.510     2.24  2.48e- 2   NA         NA    intercept
#> 3 3|4      3.38      0.638     5.29  1.21e- 7   NA         NA    intercept
#> 4 4|5      4.94      0.751     6.58  4.66e-11   NA         NA    intercept
#> 5 temp…    2.32      0.701     3.31  9.28e- 4    1.20       3.52 location 
#> 6 cont…    1.35      0.660     2.04  4.13e- 2    0.284      2.47 location 
#> 7 temp…    0.360     0.924     0.389 6.97e- 1   -1.17       1.89 location 
tidy(fit, conf.int = TRUE, conf.type = "Wald", exponentiate = TRUE)
#> # A tibble: 7 × 8
#>   term  estimate std.error statistic  p.value conf.low conf.high coef.type
#>   <chr>    <dbl>     <dbl>     <dbl>    <dbl>    <dbl>     <dbl> <chr>    
#> 1 1|2      0.244     0.545    -2.59  9.66e- 3   0.0837     0.710 intercept
#> 2 2|3      3.14      0.510     2.24  2.48e- 2   1.16       8.52  intercept
#> 3 3|4     29.3       0.638     5.29  1.21e- 7   8.38     102.    intercept
#> 4 4|5    140.        0.751     6.58  4.66e-11  32.1      610.    intercept
#> 5 temp…   10.2       0.701     3.31  9.28e- 4   2.58      40.2   location 
#> 6 cont…    3.85      0.660     2.04  4.13e- 2   1.05      14.0   location 
#> 7 temp…    1.43      0.924     0.389 6.97e- 1   0.234      8.76  location 

glance(fit)
#> # A tibble: 1 × 6
#>     edf   AIC   BIC logLik   df.residual  nobs
#>   <int> <dbl> <dbl> <logLik>       <dbl> <dbl>
#> 1     7  187.  203. -86.4162          65    72
augment(fit, type.predict = "prob")
#> # A tibble: 72 × 4
#>    rating temp  contact .fitted
#>    <ord>  <fct> <fct>     <dbl>
#>  1 2      cold  no       0.562 
#>  2 3      cold  no       0.209 
#>  3 3      cold  yes      0.435 
#>  4 4      cold  yes      0.0894
#>  5 4      warm  no       0.190 
#>  6 4      warm  no       0.190 
#>  7 5      warm  yes      0.286 
#>  8 5      warm  yes      0.286 
#>  9 1      cold  no       0.196 
#> 10 2      cold  no       0.562 
#> # ℹ 62 more rows
augment(fit, type.predict = "class")
#> # A tibble: 72 × 4
#>    rating temp  contact .fitted
#>    <ord>  <fct> <fct>   <fct>  
#>  1 2      cold  no      2      
#>  2 3      cold  no      2      
#>  3 3      cold  yes     3      
#>  4 4      cold  yes     3      
#>  5 4      warm  no      3      
#>  6 4      warm  no      3      
#>  7 5      warm  yes     4      
#>  8 5      warm  yes     4      
#>  9 1      cold  no      2      
#> 10 2      cold  no      2      
#> # ℹ 62 more rows

# ...and again with another model specification
fit2 <- clm(rating ~ temp, nominal = ~contact, data = wine)

tidy(fit2)
#> # A tibble: 9 × 6
#>   term            estimate std.error statistic      p.value coef.type
#>   <chr>              <dbl>     <dbl>     <dbl>        <dbl> <chr>    
#> 1 1|2.(Intercept)    -1.32     0.562     -2.35 0.0186       intercept
#> 2 2|3.(Intercept)     1.25     0.475      2.63 0.00866      intercept
#> 3 3|4.(Intercept)     3.55     0.656      5.41 0.0000000625 intercept
#> 4 4|5.(Intercept)     4.66     0.860      5.42 0.0000000608 intercept
#> 5 1|2.contactyes     -1.62     1.16      -1.39 0.164        intercept
#> 6 2|3.contactyes     -1.51     0.591     -2.56 0.0105       intercept
#> 7 3|4.contactyes     -1.67     0.649     -2.58 0.00985      intercept
#> 8 4|5.contactyes     -1.05     0.897     -1.17 0.241        intercept
#> 9 tempwarm            2.52     0.535      4.71 0.00000250   location 
glance(fit2)
#> # A tibble: 1 × 6
#>     edf   AIC   BIC logLik    df.residual  nobs
#>   <int> <dbl> <dbl> <logLik>        <dbl> <dbl>
#> 1     9  190.  211. -86.20855          63    72

相关用法


注：本文由纯净天空筛选整理自等大神的英文原创作品 Tidy a(n) clm object。非经特殊声明，原始代码版权归原作者所有，本译文未经允许或授权，请勿转载或复制。