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R broom augment.speedlm 使用来自 speedlm 对象的信息增强数据


Augment 接受模型对象和数据集,并添加有关数据集中每个观察值的信息。最常见的是,这包括 .fitted 列中的预测值、.resid 列中的残差以及 .se.fit 列中拟合值的标准误差。新列始终以 . 前缀开头,以避免覆盖原始数据集中的列。

用户可以通过 data 参数或 newdata 参数传递数据以进行增强。如果用户将数据传递给 data 参数,则它必须正是用于拟合模型对象的数据。将数据集传递给 newdata 以扩充模型拟合期间未使用的数据。这仍然要求至少存在用于拟合模型的所有预测变量列。如果用于拟合模型的原始结果变量未包含在 newdata 中,则输出中不会包含 .resid 列。

根据是否给出 datanewdata,增强的行为通常会有所不同。这是因为通常存在与训练观察(例如影响或相关)测量相关的信息,而这些信息对于新观察没有有意义的定义。

为了方便起见,许多增强方法提供默认的 data 参数,以便 augment(fit) 将返回增强的训练数据。在这些情况下,augment 尝试根据模型对象重建原始数据,并取得了不同程度的成功。

增强数据集始终以 tibble::tibble 形式返回,其行数与传递的数据集相同。这意味着传递的数据必须可强制转换为 tibble。如果预测变量将模型作为协变量矩阵的一部分输入,例如当模型公式使用 splines::ns()stats::poly()survival::Surv() 时,它会表示为矩阵列。

我们正在定义适合各种 na.action 参数的模型的行为,但目前不保证数据丢失时的行为。

用法

# S3 method for speedlm
augment(x, data = model.frame(x), newdata = NULL, ...)

参数

x

speedglm::speedlm() 返回的 speedlm 对象。

data

base::data.frametibble::tibble() 包含用于生成对象 x 的原始数据。默认为stats::model.frame(x),以便augment(my_fit) 返回增强的原始数据。不要将新数据传递给 data 参数。增强将报告传递给 data 参数的数据的影响和烹饪距离等信息。这些度量仅针对原始训练数据定义。

newdata

base::data.frame()tibble::tibble() 包含用于创建 x 的所有原始预测变量。默认为 NULL ,表示没有任何内容传递给 newdata 。如果指定了newdata,则data 参数将被忽略。

...

附加参数。不曾用过。仅需要匹配通用签名。注意:拼写错误的参数将被吸收到 ... 中,并被忽略。如果拼写错误的参数有默认值,则将使用默认值。例如,如果您传递 conf.lvel = 0.9 ,所有计算将使用 conf.level = 0.95 进行。这里有两个异常:

  • tidy() 方法在提供 exponentiate 参数时会发出警告(如果该参数将被忽略)。

  • augment() 方法在提供 newdata 参数时会发出警告(如果该参数将被忽略)。

也可以看看

带有列的 tibble::tibble()

.fitted

拟合值或预测值。

.resid

观察值和拟合值之间的差异。

例子


# load modeling library
library(speedglm)
#> Loading required package: biglm
#> Loading required package: DBI

# fit model
mod <- speedlm(mpg ~ wt + qsec, data = mtcars, fitted = TRUE)

# summarize model fit with tidiers
tidy(mod)
#> # A tibble: 3 × 5
#>   term        estimate std.error statistic  p.value
#>   <chr>          <dbl>     <dbl>     <dbl>    <dbl>
#> 1 (Intercept)   19.7       5.25       3.76 7.65e- 4
#> 2 wt            -5.05      0.484    -10.4  2.52e-11
#> 3 qsec           0.929     0.265      3.51 1.50e- 3
glance(mod)
#> # A tibble: 1 × 11
#>   r.squared adj.r.squared statistic  p.value    df logLik   AIC   BIC
#>       <dbl>         <dbl>     <dbl>    <dbl> <int>  <dbl> <dbl> <dbl>
#> 1     0.826         0.814      69.0 9.39e-12     3  -74.4  157.  163.
#> # ℹ 3 more variables: deviance <dbl>, df.residual <int>, nobs <int>
augment(mod)
#> # A tibble: 32 × 6
#>    .rownames           mpg    wt  qsec .fitted  .resid
#>    <chr>             <dbl> <dbl> <dbl>   <dbl>   <dbl>
#>  1 Mazda RX4          21    2.62  16.5    21.8 -0.815 
#>  2 Mazda RX4 Wag      21    2.88  17.0    21.0 -0.0482
#>  3 Datsun 710         22.8  2.32  18.6    25.3 -2.53  
#>  4 Hornet 4 Drive     21.4  3.22  19.4    21.6 -0.181 
#>  5 Hornet Sportabout  18.7  3.44  17.0    18.2  0.504 
#>  6 Valiant            18.1  3.46  20.2    21.1 -2.97  
#>  7 Duster 360         14.3  3.57  15.8    16.4 -2.14  
#>  8 Merc 240D          24.4  3.19  20      22.2  2.17  
#>  9 Merc 230           22.8  3.15  22.9    25.1 -2.32  
#> 10 Merc 280           19.2  3.44  18.3    19.4 -0.185 
#> # ℹ 22 more rows

相关用法


注:本文由纯净天空筛选整理自大神的英文原创作品 Augment data with information from a(n) speedlm object。非经特殊声明,原始代码版权归原作者所有,本译文未经允许或授权,请勿转载或复制。