本文整理汇总了Python中Classifier.Classifier.get_training_set方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Classifier.get_training_set方法的具体用法？Python Classifier.get_training_set怎么用？Python Classifier.get_training_set使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Classifier.Classifier的用法示例。
在下文中一共展示了Classifier.get_training_set方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: cmdline_parser
# 需要导入模块: from Classifier import Classifier [as 别名]
# 或者: from Classifier.Classifier import get_training_set [as 别名]
dest="queries",
required=False)
parser.add_argument("-c", dest="C", required=False)
return parser
model = None
if __name__ == "__main__":
parser = cmdline_parser()
args = parser.parse_args()
gta = list(SeqIO.parse(args.gta, "fasta"))
viral = list(SeqIO.parse(args.viral, "fasta"))
model = Classifier(gta, viral)
queries = args.queries.split(',')
for query in queries:
query_seqs = list(SeqIO.parse(query, "fasta"))
gene_num = int(query[query.find('orfg')+4])
if not model:
# dist_matrix = parse_dists.get_dist_matrix(gene_num)
model = Classifier(gta, viral)
model.get_training_set()
# model.get_weights()
SVs = model.learn_SVM_model(float(args.C))
print model.classify(query_seqs)[1]