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R ggplot2 stat_ellipse 計算法行數據橢圓


計算橢圓的方法已從 car::dataEllipse 修改(Fox 和 Weisberg 2011,Friendly 和 Monette 2013)

用法

stat_ellipse(
  mapping = NULL,
  data = NULL,
  geom = "path",
  position = "identity",
  ...,
  type = "t",
  level = 0.95,
  segments = 51,
  na.rm = FALSE,
  show.legend = NA,
  inherit.aes = TRUE
)

參數

mapping

aes() 創建的一組美學映射。如果指定且inherit.aes = TRUE(默認),它將與繪圖頂層的默認映射組合。如果沒有繪圖映射,則必須提供mapping

data

該層要顯示的數據。有以下三種選擇:

如果默認為 NULL ,則數據繼承自 ggplot() 調用中指定的繪圖數據。

data.frame 或其他對象將覆蓋繪圖數據。所有對象都將被強化以生成 DataFrame 。請參閱fortify() 將為其創建變量。

將使用單個參數(繪圖數據)調用function。返回值必須是 data.frame ,並將用作圖層數據。可以從 formula 創建 function (例如 ~ head(.x, 10) )。

geom

用於顯示數據的幾何對象,可以作為 ggproto Geom 子類,也可以作為命名去除 geom_ 前綴的幾何對象的字符串(例如 "point" 而不是 "geom_point" )

position

位置調整,可以是命名調整的字符串(例如 "jitter" 使用 position_jitter ),也可以是調用位置調整函數的結果。如果需要更改調整設置,請使用後者。

...

其他參數傳遞給 layer() 。這些通常是美學,用於將美學設置為固定值,例如 colour = "red"size = 3 。它們也可能是配對的 geom/stat 的參數。

type

橢圓的類型。默認 "t" 假定多元 t 分布,"norm" 假定多元正態分布。 "euclid" 繪製一個半徑等於 level 的圓,表示距中心的歐氏距離。除非應用coord_fixed(),否則該橢圓可能不會顯示為圓形。

level

繪製橢圓的級別,或者,如果是 type="euclid" ,則為要繪製的圓的半徑。

segments

繪製橢圓時使用的線段數。

na.rm

如果 FALSE ,則默認缺失值將被刪除並帶有警告。如果 TRUE ,缺失值將被靜默刪除。

show.legend

合乎邏輯的。該層是否應該包含在圖例中? NA(默認值)包括是否映射了任何美學。 FALSE 從不包含,而 TRUE 始終包含。它也可以是一個命名的邏輯向量,以精細地選擇要顯示的美學。

inherit.aes

如果 FALSE ,則覆蓋默認美學,而不是與它們組合。這對於定義數據和美觀的輔助函數最有用,並且不應繼承默認繪圖規範的行為,例如borders()

參考

約翰·福克斯和桑福德·韋斯伯格 (2011)。一個R應用回歸伴侶,第二版。加利福尼亞州千橡市:聖人。網址:https://socialsciences.mcmaster.ca/jfox/Books/Companion/

邁克爾·友善。喬治·莫內特.約翰·福克斯。 “橢圓見解:通過橢圓幾何理解統計方法。”國家主義者。科學。 28 (1) 1 - 39,2013 年 2 月。網址:https://projecteuclid.org/journals/statistical-science/volume-28/issue-1/Elliptical-Insights-Understanding-Statistical-Methods-through-Elliptical-Geometry/10.1214/12-STS402.full

例子

ggplot(faithful, aes(waiting, eruptions)) +
  geom_point() +
  stat_ellipse()


ggplot(faithful, aes(waiting, eruptions, color = eruptions > 3)) +
  geom_point() +
  stat_ellipse()


ggplot(faithful, aes(waiting, eruptions, color = eruptions > 3)) +
  geom_point() +
  stat_ellipse(type = "norm", linetype = 2) +
  stat_ellipse(type = "t")


ggplot(faithful, aes(waiting, eruptions, color = eruptions > 3)) +
  geom_point() +
  stat_ellipse(type = "norm", linetype = 2) +
  stat_ellipse(type = "euclid", level = 3) +
  coord_fixed()


ggplot(faithful, aes(waiting, eruptions, fill = eruptions > 3)) +
  stat_ellipse(geom = "polygon")

源代碼:R/stat-ellipse.R

相關用法


注:本文由純淨天空篩選整理自Hadley Wickham等大神的英文原創作品 Compute normal data ellipses。非經特殊聲明,原始代碼版權歸原作者所有,本譯文未經允許或授權,請勿轉載或複製。