R summary.survfit 生存曲线总结

R语言 summary.survfit 位于 survival 包(package)。

说明

返回包含生存曲线、曲线置信限和其他信息的列表。

用法

  ## S3 method for class 'survfit'
summary(object, times, censored=FALSE, scale=1,
  extend=FALSE, rmean=getOption('survfit.rmean'), ...)

参数

`object`	调用 `survfit` 函数的结果。
`times`	时间向量；返回的矩阵每次将包含 1 行。向量将按升序排序；不允许缺失值。如果 `censored=T` ，则默认 `times` 向量包含 `fit` 中的所有唯一时间，否则默认 `times` 向量仅使用事件(死亡)时间。
`censored`	逻辑值：审查时间是否应该包含在输出中？如果存在 `times` 参数，则忽略此选项。
`scale`	用于重新缩放生存时间的数值，例如，如果 `survfit` 的输入数据以天为单位，则 `scale = 365.25` 会将输出缩放为年。
`extend`	逻辑值：如果为 TRUE，则打印所有指定的 `times` 的信息，即使指定的 `times` 末尾没有剩余主题。仅当存在 `times` 参数时才使用此选项。
`rmean`	显示限制均值：有关详细信息，请参阅`print.survfit`
`...`	对于未来的方法

值

包含以下组件的列表：

`surv`	时间 t+0 时的生存估计。
`time`	曲线上的时间点。
`n.risk`	时间 t-0 时面临风险的受试者数量(但请参阅 `survfit` 帮助文件中有关权重的注释)。
`n.event`	如果缺少 `times` 参数，则此列是在时间 t 发生的事件数。否则，它是自上次列出以来到时间 t+0 为止发生的事件的累积数量。
`n.entered`	这仅用于计算进程生存数据。如果缺少 `times` 参数，则此列是在时间 t 进入的受试者数量。否则，它是自上次列出以来到时间 t 为止已进入的受试者的累积数量。
`n.exit.censored`	如果缺少 `times` 参数，则此列是在时间 t 未发生事件的受试者数量。否则，它是自最后列出的时间到时间 t+0 为止没有发生事件的受试者的累积数量。这仅用于计算进程生存数据。
`std.err`	生存值的标准误。
`conf.int`	生存置信区间的置信水平。
`lower`	曲线的置信限下限。
`upper`	曲线的置信上限。
`strata`	表示曲线估计的分层。如果 `strata` 不是 `NULL` ，则结果中有多条曲线，并且 `surv` 、 `time` 、 `n.risk` 等向量将包含多条曲线，首尾相连。 `strata`(因子)的级别是曲线的标签。
`call`	用于创建 `fit` 对象的语句。
`na.action`	与 `fit` 相同(如果存在)。
`table`	从 `print.survfit` 函数返回的信息表。
`type`	数据审查的类型。从合适的对象穿过。

细节

该例程有两种用途：打印指定时间点(通常每年)的生存曲线，或提取指定时间点的值以进行进一步处理。在第一种情况下，我们通常需要 extend=FALSE ，即不要打印超过曲线末尾的数据。如果 times 选项仅包含超出曲线最后一个点的值，则不会打印任何内容，并且会产生错误消息。对于第二种用法，我们几乎总是需要 extend=TRUE ，以便结果具有可预测的长度。

survfit 对象本身在每个审查或事件时间都会有一行信息，它不会保存每个唯一进入时间的信息。对于两个时间点 t1、t2 的打印输出，该函数将分别给出最小事件时间 >= t1 和 >= t2 处的危险人数，以及最大记录时间 <= t1 和 <= 处的生存曲线t2，以及时间间隔 t1 < t <= t2 内的事件和审查数量。

当使用计数过程数据调用例程时，许多用户会对太大的计数感到困惑。例如，Surv(c(0,0, 5, 5), c(2, 3, 8, 10), c(1, 0, 1, 0)) 后跟对时间 4 处的值的请求。survfit 对象仅在时间 2、3、8 和 10 处具有条目；在时间 8 有 2 个受试者处于危险之中，因此这就是将打印的内容。

例子

summary( survfit( Surv(futime, fustat)~1, data=ovarian))
summary( survfit( Surv(futime, fustat)~rx, data=ovarian))

也可以看看

survfit、print.summary.survfit

相关用法

注：本文由纯净天空筛选整理自R-devel大神的英文原创作品 Summary of a Survival Curve。非经特殊声明，原始代码版权归原作者所有，本译文未经允许或授权，请勿转载或复制。