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R summary.pyears pyears 对象的汇总函数


R语言 summary.pyears 位于 survival 包(package)。

说明

创建 person-years 结果的可打印表格。

用法

## S3 method for class 'pyears'
summary(object, header = TRUE, call = header, n = TRUE,
event = TRUE, pyears = TRUE, expected = TRUE, rate = FALSE, rr =expected,
ci.r = FALSE, ci.rr = FALSE, totals=FALSE, legend = TRUE, vline = FALSE,
vertical= TRUE, nastring=".", conf.level = 0.95,
scale = 1, ...)

参数

object

一个 pyears 对象

header

打印出一个标题,给出表中省略的观察总数、事件、person-years 和总时间(如果有)

call

打印调用记录副本

n , event , pyears , expected

逻辑参数:这些元素是否应该打印在表中?

rate , ci.r

逻辑论证:表中是否应该给出发生率和/或其置信区间?

rr , ci.rr

逻辑论证:表中是否应该给出风险比和/或其置信区间?

totals

应该添加行和列总计吗?

legend

打印输出中应该包含图例吗?

vline

打印的表格中是否应该包含垂直线?

vertical

当只有一个预测变量时,表格中的预测变量应该打印在左侧(垂直 = TRUE)还是横跨顶部(垂直 = FALSE)?

nastring

表中缺失值的使用方法。其中一些是结构性的,例如没有随访时间的细胞的风险比。

conf.level

任何置信区间的置信水平

scale

打印费率的比例因子

...

将传递给 format 函数的可选参数;常见的选择是digits=2 或nsmall=1。

细节

pyears 函数通常用于创建生存变量或 time-to-event 变量的初始说明;论文“表 1”中经常出现的材料类型。摘要例程使用 pandoc 表样式之一打印此信息。选择这种风格的主要原因是 Rstudio 能够自动以多种格式渲染结果:html、rtf、latex 等。

如果 pyears 调用只有一个协变量,则该表将将该协变量作为一个边距,将感兴趣的统计数据作为另一个边距。如果 pyears 调用有两个预测变量,则这两个预测变量将用作表的边距,而表的每个单元格包含感兴趣的统计数据作为单元格内的多行。如果有两个以上的预测变量,则会生成多个表,其顺序与数组的标准 R 打印输出相同。

pyears 对象的 "N" 条目是对特定单元格做出贡献的观测值数量。当原始调用包含 tcut 对象时,单个观察可能会对多个单元格做出贡献。

对象的副本

注意

pandoc系统有四种表格类型:有或没有竖线,每个单元格中有单行或多行数据。此例程根据选项生成所有 4 种样式,但目前并非所有样式都能被 Rstudio-pandoc 管道识别。 (我们还不明白为什么。)

作者

Terry Therneau and Elizabeth Atkinson

也可以看看

cipoisson , pyears , format

相关用法


注:本文由纯净天空筛选整理自R-devel大神的英文原创作品 Summary function for pyears objecs。非经特殊声明,原始代码版权归原作者所有,本译文未经允许或授权,请勿转载或复制。