R summary.pyears pyears 对象的汇总函数

说明

创建 person-years 结果的可打印表格。

用法

## S3 method for class 'pyears'
summary(object, header = TRUE, call = header, n = TRUE,
event = TRUE, pyears = TRUE, expected = TRUE, rate = FALSE, rr =expected,
ci.r = FALSE, ci.rr = FALSE, totals=FALSE, legend = TRUE, vline = FALSE,
vertical= TRUE, nastring=".", conf.level = 0.95,
scale = 1, ...)

参数

object	一个 pyears 对象
header	打印出一个标题，给出表中省略的观察总数、事件、person-years 和总时间(如果有)
call	打印调用记录副本
n , event , pyears , expected	逻辑参数：这些元素是否应该打印在表中？
rate , ci.r	逻辑论证：表中是否应该给出发生率和/或其置信区间？
rr , ci.rr	逻辑论证：表中是否应该给出风险比和/或其置信区间？
totals	应该添加行和列总计吗？
legend	打印输出中应该包含图例吗？
vline	打印的表格中是否应该包含垂直线？
vertical	当只有一个预测变量时，表格中的预测变量应该打印在左侧(垂直 = TRUE)还是横跨顶部(垂直 = FALSE)？
nastring	表中缺失值的使用方法。其中一些是结构性的，例如没有随访时间的细胞的风险比。
conf.level	任何置信区间的置信水平
scale	打印费率的比例因子
...	将传递给 format 函数的可选参数；常见的选择是digits=2 或nsmall=1。

细节

pyears 函数通常用于创建生存变量或 time-to-event 变量的初始说明；论文“表 1”中经常出现的材料类型。摘要例程使用 pandoc 表样式之一打印此信息。选择这种风格的主要原因是 Rstudio 能够自动以多种格式渲染结果：html、rtf、latex 等。

如果 pyears 调用只有一个协变量，则该表将将该协变量作为一个边距，将感兴趣的统计数据作为另一个边距。如果 pyears 调用有两个预测变量，则这两个预测变量将用作表的边距，而表的每个单元格包含感兴趣的统计数据作为单元格内的多行。如果有两个以上的预测变量，则会生成多个表，其顺序与数组的标准 R 打印输出相同。

pyears 对象的 "N" 条目是对特定单元格做出贡献的观测值数量。当原始调用包含 tcut 对象时，单个观察可能会对多个单元格做出贡献。

值

对象的副本

注意

pandoc系统有四种表格类型：有或没有竖线，每个单元格中有单行或多行数据。此例程根据选项生成所有 4 种样式，但目前并非所有样式都能被 Rstudio-pandoc 管道识别。 (我们还不明白为什么。)

作者

Terry Therneau and Elizabeth Atkinson

也可以看看

cipoisson , pyears , format