summary.pyears
位於 survival
包(package)。 說明
創建 person-years 結果的可打印表格。
用法
## S3 method for class 'pyears'
summary(object, header = TRUE, call = header, n = TRUE,
event = TRUE, pyears = TRUE, expected = TRUE, rate = FALSE, rr =expected,
ci.r = FALSE, ci.rr = FALSE, totals=FALSE, legend = TRUE, vline = FALSE,
vertical= TRUE, nastring=".", conf.level = 0.95,
scale = 1, ...)
參數
object |
一個 pyears 對象 |
header |
打印出一個標題,給出表中省略的觀察總數、事件、person-years 和總時間(如果有) |
call |
打印調用記錄副本 |
n , event , pyears , expected |
邏輯參數:這些元素是否應該打印在表中? |
rate , ci.r |
邏輯論證:表中是否應該給出發生率和/或其置信區間? |
rr , ci.rr |
邏輯論證:表中是否應該給出風險比和/或其置信區間? |
totals |
應該添加行和列總計嗎? |
legend |
打印輸出中應該包含圖例嗎? |
vline |
打印的表格中是否應該包含垂直線? |
vertical |
當隻有一個預測變量時,表格中的預測變量應該打印在左側(垂直 = TRUE)還是橫跨頂部(垂直 = FALSE)? |
nastring |
表中缺失值的使用方法。其中一些是結構性的,例如沒有隨訪時間的細胞的風險比。 |
conf.level |
任何置信區間的置信水平 |
scale |
打印費率的比例因子 |
... |
將傳遞給 |
細節
pyears
函數通常用於創建生存變量或 time-to-event 變量的初始說明;論文“表 1”中經常出現的材料類型。摘要例程使用 pandoc 表樣式之一打印此信息。選擇這種風格的主要原因是 Rstudio 能夠自動以多種格式渲染結果:html、rtf、latex 等。
如果 pyears
調用隻有一個協變量,則該表將將該協變量作為一個邊距,將感興趣的統計數據作為另一個邊距。如果 pyears
調用有兩個預測變量,則這兩個預測變量將用作表的邊距,而表的每個單元格包含感興趣的統計數據作為單元格內的多行。如果有兩個以上的預測變量,則會生成多個表,其順序與數組的標準 R 打印輸出相同。
pyears 對象的 "N" 條目是對特定單元格做出貢獻的觀測值數量。當原始調用包含 tcut
對象時,單個觀察可能會對多個單元格做出貢獻。
值
對象的副本
注意
pandoc係統有四種表格類型:有或沒有豎線,每個單元格中有單行或多行數據。此例程根據選項生成所有 4 種樣式,但目前並非所有樣式都能被 Rstudio-pandoc 管道識別。 (我們還不明白為什麽。)
作者
Terry Therneau and Elizabeth Atkinson
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注:本文由純淨天空篩選整理自R-devel大神的英文原創作品 Summary function for pyears objecs。非經特殊聲明,原始代碼版權歸原作者所有,本譯文未經允許或授權,請勿轉載或複製。