R survfitcoxph.fit survfit.coxph“計算引擎”的直接接口

R語言 survfitcoxph.fit 位於 survival 包(package)。

該程序主要用於允許其他包在‘data’級別而不是‘user’級別調用survfit.coxph函數。它不對提供的輸入數據進行檢查，如果數據錯誤，可能會導致意外錯誤。

survfitcoxph.fit(y, x, wt, x2, risk, newrisk, strata, se.fit, survtype,
vartype, varmat, id, y2, strata2, unlist=TRUE)

`y`	Cox 模型中使用的響應變量。 (當然刪除了缺失值。)
`x`	Cox 模型中使用的協變量矩陣
`wt`	Cox 模型的權重向量。如果模型未加權，則使用 1 的向量。
`x2`	說明需要曲線的假設主題的矩陣。列數必須與 `x` 相同。
`risk`	來自擬合 Cox 模型的風險評分 exp(X beta)。如果模型有偏移，請將其包含在 exp 的參數中。
`newrisk`	假設受試者的風險評分
`strata`	Cox 模型中使用的層變量。這將是一個因子。
`se.fit`	如果 `TRUE` 返回曲線的標準誤差
`survtype`	1=Kalbfleisch-Prentice，2=Nelson-Aalen，3=埃夫隆。通常將此與 `coxph` 模型中使用的關係近似值相匹配：‘exact’ 為 KP，‘breslow’ 為 N-A，‘efron’ 為 Efron。
`vartype`	1=格林伍德、2=阿倫、3=埃夫隆
`varmat`	係數的方差矩陣
`id`	可選的;如果存在且不為 NULL，則這應該是長度為 `nrow(x2)` 的標識符向量。 mon-null 值表示 `x2` 包含時間相關協變量，在這種情況下，它標識 `x2` 的哪些行與每個主題相關。
`y2`	生存時間，用於時間相關的預測。它給出了 `x2` 每行的時間範圍 (time1,time2]。注意：這必須是 Surv 對象，因此包含一個狀態指示器，但在例程中從未使用過。
`strata2`	`x2` 的分層指標向量。這一定是一個因子。
`unlist`	如果`FALSE`，結果將是一個列表，每一層都有一個元素。否則，各層將以“unpacked” 的形式呈現在`survfit` 對象中。

包含 survfit 對象的幾乎所有組件的列表。所缺少的隻是添加置信區間、原始模型響應的類型(如在 coxph 對象中)和類。

該函數和 survfit.coxph 的源代碼都是使用 noweb 編寫的。有關完整文檔，請參閱inst/sourcecode.pdf 文件。

Terry Therneau

相關用法

注：本文由純淨天空篩選整理自R-devel大神的英文原創作品 A direct interface to the ‘computational engine’ of survfit.coxph。非經特殊聲明，原始代碼版權歸原作者所有，本譯文未經允許或授權，請勿轉載或複製。