R summary.survfit 生存曲線總結

R語言 summary.survfit 位於 survival 包(package)。

說明

返回包含生存曲線、曲線置信限和其他信息的列表。

用法

  ## S3 method for class 'survfit'
summary(object, times, censored=FALSE, scale=1,
  extend=FALSE, rmean=getOption('survfit.rmean'), ...)

參數

`object`	調用 `survfit` 函數的結果。
`times`	時間向量；返回的矩陣每次將包含 1 行。向量將按升序排序；不允許缺失值。如果 `censored=T` ，則默認 `times` 向量包含 `fit` 中的所有唯一時間，否則默認 `times` 向量僅使用事件(死亡)時間。
`censored`	邏輯值：審查時間是否應該包含在輸出中？如果存在 `times` 參數，則忽略此選項。
`scale`	用於重新縮放生存時間的數值，例如，如果 `survfit` 的輸入數據以天為單位，則 `scale = 365.25` 會將輸出縮放為年。
`extend`	邏輯值：如果為 TRUE，則打印所有指定的 `times` 的信息，即使指定的 `times` 末尾沒有剩餘主題。僅當存在 `times` 參數時才使用此選項。
`rmean`	顯示限製均值：有關詳細信息，請參閱`print.survfit`
`...`	對於未來的方法

值

包含以下組件的列表：

`surv`	時間 t+0 時的生存估計。
`time`	曲線上的時間點。
`n.risk`	時間 t-0 時麵臨風險的受試者數量(但請參閱 `survfit` 幫助文件中有關權重的注釋)。
`n.event`	如果缺少 `times` 參數，則此列是在時間 t 發生的事件數。否則，它是自上次列出以來到時間 t+0 為止發生的事件的累積數量。
`n.entered`	這僅用於計算進程生存數據。如果缺少 `times` 參數，則此列是在時間 t 進入的受試者數量。否則，它是自上次列出以來到時間 t 為止已進入的受試者的累積數量。
`n.exit.censored`	如果缺少 `times` 參數，則此列是在時間 t 未發生事件的受試者數量。否則，它是自最後列出的時間到時間 t+0 為止沒有發生事件的受試者的累積數量。這僅用於計算進程生存數據。
`std.err`	生存值的標準誤。
`conf.int`	生存置信區間的置信水平。
`lower`	曲線的置信限下限。
`upper`	曲線的置信上限。
`strata`	表示曲線估計的分層。如果 `strata` 不是 `NULL` ，則結果中有多條曲線，並且 `surv` 、 `time` 、 `n.risk` 等向量將包含多條曲線，首尾相連。 `strata`(因子)的級別是曲線的標簽。
`call`	用於創建 `fit` 對象的語句。
`na.action`	與 `fit` 相同(如果存在)。
`table`	從 `print.survfit` 函數返回的信息表。
`type`	數據審查的類型。從合適的對象穿過。

細節

該例程有兩種用途：打印指定時間點(通常每年)的生存曲線，或提取指定時間點的值以進行進一步處理。在第一種情況下，我們通常需要 extend=FALSE ，即不要打印超過曲線末尾的數據。如果 times 選項僅包含超出曲線最後一個點的值，則不會打印任何內容，並且會產生錯誤消息。對於第二種用法，我們幾乎總是需要 extend=TRUE ，以便結果具有可預測的長度。

survfit 對象本身在每個審查或事件時間都會有一行信息，它不會保存每個唯一進入時間的信息。對於兩個時間點 t1、t2 的打印輸出，該函數將分別給出最小事件時間 >= t1 和 >= t2 處的危險人數，以及最大記錄時間 <= t1 和 <= 處的生存曲線t2，以及時間間隔 t1 < t <= t2 內的事件和審查數量。

當使用計數過程數據調用例程時，許多用戶會對太大的計數感到困惑。例如，Surv(c(0,0, 5, 5), c(2, 3, 8, 10), c(1, 0, 1, 0)) 後跟對時間 4 處的值的請求。survfit 對象僅在時間 2、3、8 和 10 處具有條目；在時間 8 有 2 個受試者處於危險之中，因此這就是將打印的內容。

例子

summary( survfit( Surv(futime, fustat)~1, data=ovarian))
summary( survfit( Surv(futime, fustat)~rx, data=ovarian))

也可以看看

survfit、print.summary.survfit

相關用法

注：本文由純淨天空篩選整理自R-devel大神的英文原創作品 Summary of a Survival Curve。非經特殊聲明，原始代碼版權歸原作者所有，本譯文未經允許或授權，請勿轉載或複製。