R语言
mgus
位于 survival
包(package)。 说明
241 名患有意义未明的单克隆丙种球蛋白病 (MGUS) 受试者的自然史。
用法
mgus
mgus1
data(cancer, package="survival")
格式
mgus:包含以下 12 个变量的 241 个观察值的 DataFrame 。
ID: | 主题 ID |
年龄: | 检测到 MGUS 时的年龄 |
性别: | male 或 female |
dxyr: | 诊断年份 |
个人电脑: | 对于进展为浆细胞恶性肿瘤的受试者 |
恶性肿瘤的亚型:多发性骨髓瘤 (MM) | |
最常见,其次是淀粉样变性(AM)、巨球蛋白血症(MA)、 | |
和其他淋巴增生性疾病 (LP) | |
电脑时间: | 从 MGUS 到诊断出浆细胞恶性肿瘤的天数 |
未来: | 从诊断到最后一次随访的天数 |
死亡: | 1=随访直至死亡 |
白蛋白: | MGUS 诊断时的白蛋白水平 |
创建: | MGUS 诊断时肌酐 |
血红蛋白: | MGUS 诊断时的血红蛋白 |
mspike: | 诊断时单克隆蛋白尖峰的大小 |
mgus1:开始、停止格式的相同数据集。包含上述 ID、年龄、性别和实验室变量以及
开始、停止: | 每个科目的连续时间间隔 |
地位: | =1 如果间隔以事件结束 |
事件: | 包含事件类型的因子:审查、死亡或浆细胞恶性肿瘤 |
枚举: | 每个主题的事件编号:1 或 2 |
细节
浆细胞负责制造免疫球蛋白,免疫球蛋白是免疫防御的重要组成部分。在任何给定时间,循环中估计有大约 不同的免疫球蛋白。当患者患有浆细胞恶性肿瘤时,分布将由单一同种型(恶性克隆的产物)主导,在血清蛋白电泳上表现为尖峰。意义不明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)是指存在这种尖峰,但患者没有明显恶性肿瘤的证据。 Mayo Clinic 的 241 名连续受试者数据集是定义此类受试者自然史的开创性研究。由于主要研究者的勤奋,0 名受试者失访。
三名受试者在死亡当天检测到 MGUS。在数据集 mgus1
中,这些受试者在死亡前将 MGUS 编码为 0.5 天,以避免时间紧张。
这些数据集于 2015 年 1 月更新,纠正了一些小错误。
例子
# Create the competing risk curves for time to first of death or PCM
sfit <- survfit(Surv(start, stop, event) ~ sex, mgus1, id=id,
subset=(enum==1))
print(sfit) # the order of printout is the order in which they plot
plot(sfit, xscale=365.25, lty=c(2,2,1,1), col=c(1,2,1,2),
xlab="Years after MGUS detection", ylab="Proportion")
legend(0, .8, c("Death/male", "Death/female", "PCM/male", "PCM/female"),
lty=c(1,1,2,2), col=c(2,1,2,1), bty='n')
title("Curves for the first of plasma cell malignancy or death")
# The plot shows that males have a higher death rate than females (no
# surprise) but their rates of conversion to PCM are essentially the same.
来源
梅奥诊所的数据由 Robert Kyle 博士提供。
参考
R Kyle, Benign monoclonal gammopathy - after 20 to 35 years of follow-up, Mayo Clinic Proc 1993; 68:26-36.
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注:本文由纯净天空筛选整理自R-devel大神的英文原创作品 Monoclonal gammopathy data。非经特殊声明,原始代码版权归原作者所有,本译文未经允许或授权,请勿转载或复制。