R語言
mgus
位於 survival
包(package)。 說明
241 名患有意義未明的單克隆丙種球蛋白病 (MGUS) 受試者的自然史。
用法
mgus
mgus1
data(cancer, package="survival")
格式
mgus:包含以下 12 個變量的 241 個觀察值的 DataFrame 。
ID: | 主題 ID |
年齡: | 檢測到 MGUS 時的年齡 |
性別: | male 或 female |
dxyr: | 診斷年份 |
個人電腦: | 對於進展為漿細胞惡性腫瘤的受試者 |
惡性腫瘤的亞型:多發性骨髓瘤 (MM) | |
最常見,其次是澱粉樣變性(AM)、巨球蛋白血症(MA)、 | |
和其他淋巴增生性疾病 (LP) | |
電腦時間: | 從 MGUS 到診斷出漿細胞惡性腫瘤的天數 |
未來: | 從診斷到最後一次隨訪的天數 |
死亡: | 1=隨訪直至死亡 |
白蛋白: | MGUS 診斷時的白蛋白水平 |
創建: | MGUS 診斷時肌酐 |
血紅蛋白: | MGUS 診斷時的血紅蛋白 |
mspike: | 診斷時單克隆蛋白尖峰的大小 |
mgus1:開始、停止格式的相同數據集。包含上述 ID、年齡、性別和實驗室變量以及
開始、停止: | 每個科目的連續時間間隔 |
地位: | =1 如果間隔以事件結束 |
事件: | 包含事件類型的因子:審查、死亡或漿細胞惡性腫瘤 |
枚舉: | 每個主題的事件編號:1 或 2 |
細節
漿細胞負責製造免疫球蛋白,免疫球蛋白是免疫防禦的重要組成部分。在任何給定時間,循環中估計有大約 不同的免疫球蛋白。當患者患有漿細胞惡性腫瘤時,分布將由單一同種型(惡性克隆的產物)主導,在血清蛋白電泳上表現為尖峰。意義不明的單克隆丙種球蛋白病(MGUS)是指存在這種尖峰,但患者沒有明顯惡性腫瘤的證據。 Mayo Clinic 的 241 名連續受試者數據集是定義此類受試者自然史的開創性研究。由於主要研究者的勤奮,0 名受試者失訪。
三名受試者在死亡當天檢測到 MGUS。在數據集 mgus1
中,這些受試者在死亡前將 MGUS 編碼為 0.5 天,以避免時間緊張。
這些數據集於 2015 年 1 月更新,糾正了一些小錯誤。
例子
# Create the competing risk curves for time to first of death or PCM
sfit <- survfit(Surv(start, stop, event) ~ sex, mgus1, id=id,
subset=(enum==1))
print(sfit) # the order of printout is the order in which they plot
plot(sfit, xscale=365.25, lty=c(2,2,1,1), col=c(1,2,1,2),
xlab="Years after MGUS detection", ylab="Proportion")
legend(0, .8, c("Death/male", "Death/female", "PCM/male", "PCM/female"),
lty=c(1,1,2,2), col=c(2,1,2,1), bty='n')
title("Curves for the first of plasma cell malignancy or death")
# The plot shows that males have a higher death rate than females (no
# surprise) but their rates of conversion to PCM are essentially the same.
來源
梅奧診所的數據由 Robert Kyle 博士提供。
參考
R Kyle, Benign monoclonal gammopathy - after 20 to 35 years of follow-up, Mayo Clinic Proc 1993; 68:26-36.
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注:本文由純淨天空篩選整理自R-devel大神的英文原創作品 Monoclonal gammopathy data。非經特殊聲明,原始代碼版權歸原作者所有,本譯文未經允許或授權,請勿轉載或複製。