R beav2 海狸体温系列2

说明

Reynolds (1994) 说明了威斯康星州中北部海狸加拿大蓖麻 (Castor canadensis) 长期温度动态研究的一小部分。每 10 分钟通过遥测技术测量四只雌性动物的体温，但这里使用的是两只动物每只不到一天的一段时间的数据。

用法

beav2

格式

beav2 数据帧有 100 行和 4 列。该 DataFrame 包含以下列：

day

观察日(自 1990 年初以来的天数)，11 月 3 日至 4 日。

time

观察时间，格式为 0330，表示凌晨 3.30。

temp

测量的体温以摄氏度为单位。

activ

静修处外活动的指标。

例子

attach(beav2)
beav2$hours <- 24*(day-307) + trunc(time/100) + (time%%100)/60
plot(beav2$hours, beav2$temp, type = "l", xlab = "time",
   ylab = "temperature", main = "Beaver 2")
usr <- par("usr"); usr[3:4] <- c(-0.2, 8); par(usr = usr)
lines(beav2$hours, beav2$activ, type = "s", lty = 2)

temp <- ts(temp, start = 8+2/3, frequency = 6)
activ <- ts(activ, start = 8+2/3, frequency = 6)
acf(temp[activ == 0]); acf(temp[activ == 1]) # also look at PACFs
ar(temp[activ == 0]); ar(temp[activ == 1])

arima(temp, order = c(1,0,0), xreg = activ)
dreg <- cbind(sin = sin(2*pi*beav2$hours/24), cos = cos(2*pi*beav2$hours/24))
arima(temp, order = c(1,0,0), xreg = cbind(active=activ, dreg))

## IGNORE_RDIFF_BEGIN
library(nlme) # for gls and corAR1
beav2.gls <- gls(temp ~ activ, data = beav2, correlation = corAR1(0.8),
                 method = "ML")
summary(beav2.gls)
summary(update(beav2.gls, subset = 6:100))
detach("beav2"); rm(temp, activ)
## IGNORE_RDIFF_END

来源

P. S. Reynolds (1994) 海狸体温的时间序列分析。 Lange, N.、Ryan, L.、Billard, L.、Brilllinger, D.、Conquest, L. 和 Greenhouse, J. eds (1994) 生物测定案例研究第 11 章。纽约：约翰·威利父子公司。

参考

Venables, W. N. and Ripley, B. D. (2002) Modern Applied Statistics with S. Fourth edition. Springer.

也可以看看

beav1