R beav2 海狸體溫係列2

說明

Reynolds (1994) 說明了威斯康星州中北部海狸加拿大蓖麻 (Castor canadensis) 長期溫度動態研究的一小部分。每 10 分鍾通過遙測技術測量四隻雌性動物的體溫，但這裏使用的是兩隻動物每隻不到一天的一段時間的數據。

用法

beav2

格式

beav2 數據幀有 100 行和 4 列。該 DataFrame 包含以下列：

day

觀察日(自 1990 年初以來的天數)，11 月 3 日至 4 日。

time

觀察時間，格式為 0330，表示淩晨 3.30。

temp

測量的體溫以攝氏度為單位。

activ

靜修處外活動的指標。

例子

attach(beav2)
beav2$hours <- 24*(day-307) + trunc(time/100) + (time%%100)/60
plot(beav2$hours, beav2$temp, type = "l", xlab = "time",
   ylab = "temperature", main = "Beaver 2")
usr <- par("usr"); usr[3:4] <- c(-0.2, 8); par(usr = usr)
lines(beav2$hours, beav2$activ, type = "s", lty = 2)

temp <- ts(temp, start = 8+2/3, frequency = 6)
activ <- ts(activ, start = 8+2/3, frequency = 6)
acf(temp[activ == 0]); acf(temp[activ == 1]) # also look at PACFs
ar(temp[activ == 0]); ar(temp[activ == 1])

arima(temp, order = c(1,0,0), xreg = activ)
dreg <- cbind(sin = sin(2*pi*beav2$hours/24), cos = cos(2*pi*beav2$hours/24))
arima(temp, order = c(1,0,0), xreg = cbind(active=activ, dreg))

## IGNORE_RDIFF_BEGIN
library(nlme) # for gls and corAR1
beav2.gls <- gls(temp ~ activ, data = beav2, correlation = corAR1(0.8),
                 method = "ML")
summary(beav2.gls)
summary(update(beav2.gls, subset = 6:100))
detach("beav2"); rm(temp, activ)
## IGNORE_RDIFF_END

來源

P. S. Reynolds (1994) 海狸體溫的時間序列分析。 Lange, N.、Ryan, L.、Billard, L.、Brilllinger, D.、Conquest, L. 和 Greenhouse, J. eds (1994) 生物測定案例研究第 11 章。紐約：約翰·威利父子公司。

參考

Venables, W. N. and Ripley, B. D. (2002) Modern Applied Statistics with S. Fourth edition. Springer.

也可以看看

beav1