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R beav1 海狸体温系列1


R语言 beav1 位于 MASS 包(package)。

说明

Reynolds (1994) 说明了威斯康星州中北部海狸加拿大蓖麻 (Castor canadensis) 长期温度动态研究的一小部分。每 10 分钟通过遥测技术测量四只雌性动物的体温,但这里使用的是两只动物每只不到一天的一段时间的数据。

用法

beav1

格式

beav1 数据帧有 114 行和 4 列。该 DataFrame 包含以下列:

day

观察日(自 1990 年初以来的天数),12 月 12 日至 13 日。

time

观察时间,格式为 0330,表示凌晨 3.30。

temp

测量的体温以摄氏度为单位。

activ

静修处外活动的指标。

注意

22:20 的观测值缺失。

例子

beav1 <- within(beav1,
               hours <- 24*(day-346) + trunc(time/100) + (time%%100)/60)
plot(beav1$hours, beav1$temp, type="l", xlab="time",
   ylab="temperature", main="Beaver 1")
usr <- par("usr"); usr[3:4] <- c(-0.2, 8); par(usr=usr)
lines(beav1$hours, beav1$activ, type="s", lty=2)
temp <- ts(c(beav1$temp[1:82], NA, beav1$temp[83:114]),
           start = 9.5, frequency = 6)
activ <- ts(c(beav1$activ[1:82], NA, beav1$activ[83:114]),
            start = 9.5, frequency = 6)

acf(temp[1:53])
acf(temp[1:53], type = "partial")
ar(temp[1:53])
act <- c(rep(0, 10), activ)
X <- cbind(1, act = act[11:125], act1 = act[10:124],
          act2 = act[9:123], act3 = act[8:122])
alpha <- 0.80
stemp <- as.vector(temp - alpha*lag(temp, -1))
sX <- X[-1, ] - alpha * X[-115,]
beav1.ls <- lm(stemp ~ -1 + sX, na.action = na.omit)
summary(beav1.ls, correlation = FALSE)
rm(temp, activ)

来源

P. S. Reynolds (1994) 海狸体温的时间序列分析。 Lange, N.、Ryan, L.、Billard, L.、Brilllinger, D.、Conquest, L. 和 Greenhouse, J. eds (1994) 生物测定案例研究第 11 章。纽约:约翰·威利父子公司。

参考

Venables, W. N. and Ripley, B. D. (2002) Modern Applied Statistics with S. Fourth edition. Springer.

也可以看看

beav2

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注:本文由纯净天空筛选整理自R-devel大神的英文原创作品 Body Temperature Series of Beaver 1。非经特殊声明,原始代码版权归原作者所有,本译文未经允许或授权,请勿转载或复制。