R coef.lme 提取lme系数

R语言 coef.lme 位于 nlme 包(package)。

说明

通过将小于或等于 i 的分组级别的固定效应估计和相应的随机效应估计相加，获得级别 i 的估计系数。得到的估计值作为 DataFrame 返回，其中行对应于组，列对应于系数。可选地，返回的数据帧可以用在组上总结的协变量来扩充。

用法

## S3 method for class 'lme'
coef(object, augFrame, level, data, which, FUN, 
       omitGroupingFactor, subset, ...)

参数

`object`	继承自类 `"lme"` 的对象，表示拟合的线性混合效果模型。
`augFrame`	可选的逻辑值。如果是 `TRUE` ，则返回的数据帧将使用 `data` 中定义的变量进行扩充；否则，如果 `FALSE` ，则仅返回系数。默认为 `FALSE` 。
`level`	一个可选的正整数，给出用于从具有多个嵌套分组级别的对象中提取系数的分组级别。默认为最高或最内层的分组。
`data`	可选数据帧，其中包含用于在 `augFrame = TRUE` 时扩充返回的数据帧的变量。默认为用于适合 `object` 的 DataFrame 。
`which`	可选的正整数或字符向量，指定应在返回数据帧的扩充中使用 `data` 的哪些列。默认为 `data` 中的所有列。
`FUN`	当按组折叠 `data` 时，应用于 group-varying 变量的可选汇总函数或汇总函数列表。 Group-invariant 变量始终按它们在该组中假定的唯一值进行汇总。如果 `FUN` 是单个函数，它将按组应用于每个非不变变量以生成该变量的摘要。如果 `FUN` 是函数列表，则列表中的名称应指定框架中的变量类，例如 `ordered` 、 `factor` 或 `numeric` 。指示的函数将应用于该类的任何group-varying变量。要使用的默认函数是 `mean` (用于数字因子)和 `Mode` (用于 `factor` 和 `ordered` )。 `Mode` 函数在 `gsummary` 内部定义，返回变量的模态值或最常用值。它与返回变量的S-language模式的`mode`函数不同。
`omitGroupingFactor`	可选的逻辑值。当 `TRUE` 时，分组因子本身将从 `data` 的分组摘要中省略，但分组因子的级别将继续用作返回数据帧的行名称。默认为 `FALSE` 。
`subset`	指定子集的可选表达式
`...`	该泛型的某些方法需要额外的参数。此方法中没有使用任何内容。

值

继承自类 "coef.lme" 的数据帧，具有 level 级别的估计系数，以及(可选)在组上汇总的其他协变量。返回的对象也继承自类 "ranef.lme" 和 "data.frame" 。

例子

fm1 <- lme(distance ~ age, Orthodont, random = ~ age | Subject)
coef(fm1)
coef(fm1, augFrame = TRUE)

作者

José Pinheiro and Douglas Bates bates@stat.wisc.edu

参考

Pinheiro, J. C. and Bates, D. M. (2000), Mixed-Effects Models in S and S-PLUS, Springer, New York, esp. pp. 455-457.

也可以看看

lme、ranef.lme、plot.ranef.lme、gsummary

相关用法

注：本文由纯净天空筛选整理自R-devel大神的英文原创作品 Extract lme Coefficients。非经特殊声明，原始代码版权归原作者所有，本译文未经允许或授权，请勿转载或复制。