R coef.lme 提取lme係數

R語言 coef.lme 位於 nlme 包(package)。

說明

通過將小於或等於 i 的分組級別的固定效應估計和相應的隨機效應估計相加，獲得級別 i 的估計係數。得到的估計值作為 DataFrame 返回，其中行對應於組，列對應於係數。可選地，返回的數據幀可以用在組上總結的協變量來擴充。

用法

## S3 method for class 'lme'
coef(object, augFrame, level, data, which, FUN, 
       omitGroupingFactor, subset, ...)

參數

`object`	繼承自類 `"lme"` 的對象，表示擬合的線性混合效果模型。
`augFrame`	可選的邏輯值。如果是 `TRUE` ，則返回的數據幀將使用 `data` 中定義的變量進行擴充；否則，如果 `FALSE` ，則僅返回係數。默認為 `FALSE` 。
`level`	一個可選的正整數，給出用於從具有多個嵌套分組級別的對象中提取係數的分組級別。默認為最高或最內層的分組。
`data`	可選數據幀，其中包含用於在 `augFrame = TRUE` 時擴充返回的數據幀的變量。默認為用於適合 `object` 的 DataFrame 。
`which`	可選的正整數或字符向量，指定應在返回數據幀的擴充中使用 `data` 的哪些列。默認為 `data` 中的所有列。
`FUN`	當按組折疊 `data` 時，應用於 group-varying 變量的可選匯總函數或匯總函數列表。 Group-invariant 變量始終按它們在該組中假定的唯一值進行匯總。如果 `FUN` 是單個函數，它將按組應用於每個非不變變量以生成該變量的摘要。如果 `FUN` 是函數列表，則列表中的名稱應指定框架中的變量類，例如 `ordered` 、 `factor` 或 `numeric` 。指示的函數將應用於該類的任何group-varying變量。要使用的默認函數是 `mean` (用於數字因子)和 `Mode` (用於 `factor` 和 `ordered` )。 `Mode` 函數在 `gsummary` 內部定義，返回變量的模態值或最常用值。它與返回變量的S-language模式的`mode`函數不同。
`omitGroupingFactor`	可選的邏輯值。當 `TRUE` 時，分組因子本身將從 `data` 的分組摘要中省略，但分組因子的級別將繼續用作返回數據幀的行名稱。默認為 `FALSE` 。
`subset`	指定子集的可選表達式
`...`	該泛型的某些方法需要額外的參數。此方法中沒有使用任何內容。

值

繼承自類 "coef.lme" 的數據幀，具有 level 級別的估計係數，以及(可選)在組上匯總的其他協變量。返回的對象也繼承自類 "ranef.lme" 和 "data.frame" 。

例子

fm1 <- lme(distance ~ age, Orthodont, random = ~ age | Subject)
coef(fm1)
coef(fm1, augFrame = TRUE)

作者

José Pinheiro and Douglas Bates bates@stat.wisc.edu

參考

Pinheiro, J. C. and Bates, D. M. (2000), Mixed-Effects Models in S and S-PLUS, Springer, New York, esp. pp. 455-457.

也可以看看

lme、ranef.lme、plot.ranef.lme、gsummary

相關用法

注：本文由純淨天空篩選整理自R-devel大神的英文原創作品 Extract lme Coefficients。非經特殊聲明，原始代碼版權歸原作者所有，本譯文未經允許或授權，請勿轉載或複製。