R plot.ranef.lme 繪製 ranef.lme 對象

說明

線性混合效應模型的隨機效應圖(包 lattice 中的類 "Trellis" )，即 ranef(lme(*)) 的結果(類 "ranef.lme" )。

用法

## S3 method for class 'ranef.lme'
plot(x, form = NULL, omitFixed = TRUE, level = Q,
     grid = TRUE, control, xlab, ylab, strip,
     ...)

參數

x	繼承自類 "ranef.lme" 的對象，表示生成該對象的 lme 對象的估計係數或估計隨機效應。
form	指定所需繪圖類型的可選公式。 如果作為單方麵公式給出，則返回根據 form 中命名的因子水平的所有組合分組的估計隨機效應(係數)的dotplot()。 如果作為雙邊公式給出(或默認情況下為 NULL )，則返回隨機效應(係數)與指定協變量的 xyplot() 網格顯示。在NULL 情況下，使用隨機效應(係數)的行名稱(作為協變量)。 另請參閱“詳細信息：”。
omitFixed	一個可選的邏輯值，指示是否應省略具有跨組值不變的列。默認為 TRUE 。
level	一個可選的整數值，給出用於 x 的分組級別。僅當 x 是每個分組級別具有不同組件的列表時使用。默認為最高或最內層的分組。
grid	一個可選的邏輯值，指示是否應將網格添加到繪圖中。僅適用於與 form 中的雙邊公式關聯的繪圖。默認為 TRUE 。
control	當 form 作為雙邊公式給出時，包含繪圖控製值的可選列表。控製值通過 control 列表中的名稱引用，並且隻需指定要從默認值進行修改的值。可用值包括： drawLine ，一個邏輯值，指示是否應將 loess 平滑器添加到散點圖，以及是否應將連接中位數的線添加到箱線圖(默認為 TRUE )； span.loess ，用作 panel.loess 調用中的 span 參數(默認為 2/3 )； degree.loess ，用作 panel.loess 調用中的 degree 參數(默認為 1 )； cex.axis ，x 軸的字符擴展因子(默認為 0.8 )； srt.axis ，x 軸的旋轉因子(默認為 0 )；和 mgp.axis ，x 軸的邊距參數(默認為 c(2, 0.5, 0) )。
xlab , ylab	軸標簽，每個標簽都有一個合理的默認值。
strip	function 或 FALSE ，請參閱包 lattice 中的 dotplot() 。
...	傳遞給 Trellis dotplot 函數的可選參數。

細節

如果 form 丟失，或者作為單方麵公式給出，則會生成隨機效果的格子 dot-plot(通過 pkg lattice 中的 dotplot() )，每個隨機效果都有一個不同的麵板(係數)。 dot-plot 中的行由 form 參數(如果不丟失)或隨機效應(係數)的行名稱確定。允許單因子 (~g) 或交叉因子 (~g1*g2)。對於單個因子，其水平決定dot-plot行(每行可能有多個點)；否則，如果 form 指定因子交叉，則 dot-plot 行由公式中各個因子水平的所有組合確定。

如果 form 是雙邊公式，則左側必須是單個隨機效應(係數)，右側由 x 中的協變量形成，並用 + 分隔。生成 xyplot() 網格顯示，並為 form 右側列出的每個變量提供不同的麵板。為數值變量生成散點圖，為分類( factor 或 ordered )變量生成箱線圖。

值

估計的random-effects(係數)與協變量或組的網格圖。

例子

fm1 <- lme(distance ~ age, Orthodont, random = ~ age | Subject)
plot(ranef(fm1))
fm1RE <- ranef(fm1, aug = TRUE)
plot(fm1RE, form = ~ Sex)
plot(fm1RE, form = age ~ Sex) # "connected" boxplots

作者

José Pinheiro and Douglas Bates bates@stat.wisc.edu

也可以看看

ranef.lme、lme、dotplot。