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R corGaus 高斯相关结构


R语言 corGaus 位于 nlme 包(package)。

说明

该函数是corGaus类的构造函数,表示高斯空间相关结构。令 表示范围, 表示块金效应,相距 的两个观测值之间的相关性在不存在块金效应时为 ,在假设存在块金效应时为 。使用此构造函数创建的对象稍后必须使用适当的“Initialize 方法进行初始化。

用法

corGaus(value, form, nugget, metric, fixed)

参数

value

带有约束形式的参数值的可选向量。如果nuggetFALSEvalue只能有一个元素,对应高斯相关结构的"range",该元素必须大于零。如果 nuggetTRUE ,意味着存在块金效应,则 value 可以包含一个或两个元素,第一个是 "range",第二个是 "nugget effect"(一减去两个观测值之间的相关性)任意靠近);第一个必须大于零,第二个必须介于零和一之间。默认为 numeric(0) ,这会导致在初始化 object 时将最小距离的 90% 范围和 0.1 的块金效应分配给参数。

form

~ S1+...+Sp~ S1+...+Sp | g 形式的单边公式,指定空间协变量 S1Sp 以及可选的分组因子 g 。当 form 中存在分组因子时,假定相关结构仅适用于同一分组级别内的观测值;假设具有不同分组级别的观测值是不相关的。默认为 ~ 1 ,这对应于使用数据中的观察顺序作为协变量,并且没有组。

nugget

指示是否存在金块效应的可选逻辑值。默认为 FALSE

metric

指定要使用的距离度量的可选字符串。当前可用的选项是"euclidean",用于距离的平方和; "maximum"为最大差值; "manhattan" 为绝对差之和。使用参数的部分匹配,因此只需提供前三个字符。默认为 "euclidean"

fixed

一个可选的逻辑值,指示是否应允许系数在优化中变化,或保持固定在其初始值。默认为 FALSE ,在这种情况下允许系数变化。

corGaus 的对象,也继承自类 corSpatial ,表示高斯空间相关结构。

例子

sp1 <- corGaus(form = ~ x + y + z)

# example lme(..., corGaus ...)
# Pinheiro and Bates, pp. 222-249
fm1BW.lme <- lme(weight ~ Time * Diet, BodyWeight,
                   random = ~ Time)
# p. 223
fm2BW.lme <- update(fm1BW.lme, weights = varPower())
# p 246 
fm3BW.lme <- update(fm2BW.lme,
           correlation = corExp(form = ~ Time))
# p. 249
fm8BW.lme <- update(fm3BW.lme, correlation = corGaus(form = ~ Time))

作者

José Pinheiro and Douglas Bates bates@stat.wisc.edu

参考

Cressie, N.A.C. (1993), "Statistics for Spatial Data", J. Wiley & Sons.

Venables, W.N. and Ripley, B.D. (2002) "Modern Applied Statistics with S", 4th Edition, Springer-Verlag.

Littel, Milliken, Stroup, and Wolfinger (1996) "SAS Systems for Mixed Models", SAS Institute.

Pinheiro, J.C., and Bates, D.M. (2000) "Mixed-Effects Models in S and S-PLUS", Springer.

也可以看看

Initialize.corStruct , summary.corStruct , dist

相关用法


注:本文由纯净天空筛选整理自R-devel大神的英文原创作品 Gaussian Correlation Structure。非经特殊声明,原始代码版权归原作者所有,本译文未经允许或授权,请勿转载或复制。