R语言
VarCorr
位于 nlme
包(package)。 说明
此函数计算 "lme"
类线性混合效应模型或 "nlme"
类非线性混合效应模型中 random-effects 项之间的估计方差、标准差和相关性。还计算组内误差方差和标准差。
用法
VarCorr(x, sigma = 1, ...)
## S3 method for class 'lme'
VarCorr(x, sigma = x$sigma, rdig = 3, ...)
## S3 method for class 'pdMat'
VarCorr(x, sigma = 1, rdig = 3, ...)
## S3 method for class 'pdBlocked'
VarCorr(x, sigma = 1, rdig = 3, ...)
参数
x |
拟合模型对象,通常是继承自类 |
sigma |
用作标准差乘数的可选数值。默认为 |
rdig |
一个可选的整数值,指定用于表示相关估计的位数。默认为 |
... |
更多可选参数传递给其他方法(此处记录的方法没有)。 |
值
包含随机效应的估计方差、标准差和相关性的矩阵。前两列名为 Variance
和 StdDev
,分别给出方差和标准差。如果随机效应模型中存在相关性分量,则名为 Corr
的第三列和其余未命名列给出同一分组级别内随机效应之间的估计相关性。组内误差方差和标准差作为矩阵的最后一行。
例子
fm1 <- lme(distance ~ age, data = Orthodont, random = ~age)
VarCorr(fm1)
作者
José Pinheiro and Douglas Bates bates@stat.wisc.edu
参考
Pinheiro, J.C., and Bates, D.M. (2000) Mixed-Effects Models in S and S-PLUS, Springer, esp. pp. 100, 461.
也可以看看
相关用法
- R Variogram.corSpher 计算 corSpher 对象的半变异函数
- R Variogram.gls 计算 gls 对象残差的半变异函数
- R Variogram.corGaus 计算 corGaus 对象的半变异函数
- R Variogram.lme 计算 lme 对象残差的半变异函数
- R Variogram 计算半变异函数
- R Variogram.corSpatial 计算 corSpatial 对象的半变异函数
- R Variogram.corLin 计算 corLin 对象的半变异函数
- R Variogram.corExp 计算 corExp 对象的半变异函数
- R Variogram.default 计算半变异函数
- R Variogram.corRatio 计算 corRatio 对象的半变异函数
- R Pixel X 射线像素强度随时间的变化
- R corARMA ARMA(p,q) 相关结构
- R getGroupsFormula 提取分组公式
- R corRatio 有理二次相关结构
- R logLik.glsStruct glsStruct 对象的对数似然
- R intervals.lmList lmList 系数的置信区间
- R corLin 线性相关结构
- R plot.augPred 绘制 augPred 对象
- R print.varFunc 打印 varFunc 对象
- R recalc 重新计算压缩线性模型对象
- R getGroups.lme 提取 lme 对象组
- R nlmeStruct 非线性混合效应结构
- R predict.nlme 来自 nlme 对象的预测
- R corSymm 一般相关结构
- R qqnorm.gls gls 对象残差的正态图
注:本文由纯净天空筛选整理自R-devel大神的英文原创作品 Extract variance and correlation components。非经特殊声明,原始代码版权归原作者所有,本译文未经允许或授权,请勿转载或复制。