本文整理汇总了Python中Bio.MarkovModel.save方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python MarkovModel.save方法的具体用法？Python MarkovModel.save怎么用？Python MarkovModel.save使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Bio.MarkovModel的用法示例。
在下文中一共展示了MarkovModel.save方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_save_and_load
# 需要导入模块: from Bio import MarkovModel [as 别名]
# 或者: from Bio.MarkovModel import save [as 别名]
def test_save_and_load(self):
states = "NR"
alphabet = "AGTC"
p_initial = array([1.0, 0.0])
p_transition = array([[0.75, 0.25], [0.25, 0.75]])
p_emission = array(
[[0.45, 0.36, 0.06, 0.13], [0.24, 0.18, 0.12, 0.46]])
markov_model_save = MarkovModel.MarkovModel(
states,
alphabet,
p_initial,
p_transition,
p_emission)
handle = StringIO()
MarkovModel.save(markov_model_save, handle)
handle.seek(0)
markov_model_load = MarkovModel.load(handle)
self.assertEqual(''.join(markov_model_load.states), states)
self.assertEqual(''.join(markov_model_load.alphabet), alphabet)
self.assertTrue(array_equal(markov_model_load.p_initial, p_initial))
self.assertTrue(array_equal
(markov_model_load.p_transition, p_transition))
self.assertTrue(array_equal(markov_model_load.p_emission, p_emission))