本文整理汇总了Python中Bio.MarkovModel._forward方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python MarkovModel._forward方法的具体用法？Python MarkovModel._forward怎么用？Python MarkovModel._forward使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Bio.MarkovModel的用法示例。
在下文中一共展示了MarkovModel._forward方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_forward
# 需要导入模块: from Bio import MarkovModel [as 别名]
# 或者: from Bio.MarkovModel import _forward [as 别名]
def test_forward(self):
states = ["CP", "IP"]
outputs = [2, 1, 0]
lp_initial = log([1.0, 0.0000001])
lp_transition = log([[0.7, 0.3], [0.5, 0.5]])
lp_emission = log([[0.6, 0.1, 0.3], [0.1, 0.7, 0.2]])
matrix = array([[0., -1.5606477, -3.07477539, -3.84932984],
[-16.11809565, -2.4079455, -3.27544608, -4.5847794]])
self.assertTrue(
array_equal(around(MarkovModel._forward(len(states), len(outputs),
lp_initial,
lp_transition,
lp_emission,
outputs), decimals=3),
around(matrix, decimals=3)))