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R broom tidy.confusionMatrix 整理一個(n)confusionMatrix對象


Tidy 總結了有關模型組件的信息。模型組件可能是回歸中的單個項、單個假設、聚類或類。 tidy 所認為的模型組件的確切含義因模型而異,但通常是不言而喻的。如果模型具有多種不同類型的組件,您將需要指定要返回哪些組件。

用法

# S3 method for confusionMatrix
tidy(x, by_class = TRUE, ...)

參數

x

通過調用 caret::confusionMatrix() 創建的類 confusionMatrix 的對象。

by_class

邏輯指示是否顯示按類別細分的績效衡量標準。默認為 TRUE 。當 by_class = FALSE 僅返回包含準確度、kappa 和 McNemar 統計信息的 tibble 時。

...

附加參數。不曾用過。僅需要匹配通用簽名。注意:拚寫錯誤的參數將被吸收到 ... 中,並被忽略。如果拚寫錯誤的參數有默認值,則將使用默認值。例如,如果您傳遞 conf.lvel = 0.9 ,所有計算將使用 conf.level = 0.95 進行。這裏有兩個異常:

  • tidy() 方法在提供 exponentiate 參數時會發出警告(如果該參數將被忽略)。

  • augment() 方法在提供 newdata 參數時會發出警告(如果該參數將被忽略)。

也可以看看

帶有列的 tibble::tibble()

class

正在考慮的類。

conf.high

估計置信區間的上限。

conf.low

估計置信區間的下限。

estimate

回歸項的估計值。

term

回歸項的名稱。

p.value

準確性和 kappa 統計的 P 值。

例子


# load libraries for models and data
library(caret)
#> Loading required package: lattice
#> 
#> Attaching package: ‘lattice’
#> The following object is masked from ‘package:boot’:
#> 
#>     melanoma
#> 
#> Attaching package: ‘caret’
#> The following object is masked from ‘package:survival’:
#> 
#>     cluster
#> The following object is masked from ‘package:purrr’:
#> 
#>     lift

set.seed(27)

# generate data
two_class_sample1 <- as.factor(sample(letters[1:2], 100, TRUE))
two_class_sample2 <- as.factor(sample(letters[1:2], 100, TRUE))

two_class_cm <- confusionMatrix(
  two_class_sample1,
  two_class_sample2
)

# summarize model fit with tidiers
tidy(two_class_cm)
#> # A tibble: 14 × 6
#>    term                 class estimate conf.low conf.high p.value
#>    <chr>                <chr>    <dbl>    <dbl>     <dbl>   <dbl>
#>  1 accuracy             NA      0.52      0.418     0.621   0.619
#>  2 kappa                NA      0.0295   NA        NA      NA    
#>  3 mcnemar              NA     NA        NA        NA       0.470
#>  4 sensitivity          a       0.604    NA        NA      NA    
#>  5 specificity          a       0.426    NA        NA      NA    
#>  6 pos_pred_value       a       0.542    NA        NA      NA    
#>  7 neg_pred_value       a       0.488    NA        NA      NA    
#>  8 precision            a       0.542    NA        NA      NA    
#>  9 recall               a       0.604    NA        NA      NA    
#> 10 f1                   a       0.571    NA        NA      NA    
#> 11 prevalence           a       0.53     NA        NA      NA    
#> 12 detection_rate       a       0.32     NA        NA      NA    
#> 13 detection_prevalence a       0.59     NA        NA      NA    
#> 14 balanced_accuracy    a       0.515    NA        NA      NA    
tidy(two_class_cm, by_class = FALSE)
#> # A tibble: 3 × 5
#>   term     estimate conf.low conf.high p.value
#>   <chr>       <dbl>    <dbl>     <dbl>   <dbl>
#> 1 accuracy   0.52      0.418     0.621   0.619
#> 2 kappa      0.0295   NA        NA      NA    
#> 3 mcnemar   NA        NA        NA       0.470

# multiclass example
six_class_sample1 <- as.factor(sample(letters[1:6], 100, TRUE))
six_class_sample2 <- as.factor(sample(letters[1:6], 100, TRUE))

six_class_cm <- confusionMatrix(
  six_class_sample1,
  six_class_sample2
)

# summarize model fit with tidiers
tidy(six_class_cm)
#> # A tibble: 69 × 6
#>    term           class estimate conf.low conf.high p.value
#>    <chr>          <chr>    <dbl>    <dbl>     <dbl>   <dbl>
#>  1 accuracy       NA      0.2       0.127     0.292   0.795
#>  2 kappa          NA      0.0351   NA        NA      NA    
#>  3 mcnemar        NA     NA        NA        NA       0.873
#>  4 sensitivity    a       0.2      NA        NA      NA    
#>  5 specificity    a       0.888    NA        NA      NA    
#>  6 pos_pred_value a       0.308    NA        NA      NA    
#>  7 neg_pred_value a       0.816    NA        NA      NA    
#>  8 precision      a       0.308    NA        NA      NA    
#>  9 recall         a       0.2      NA        NA      NA    
#> 10 f1             a       0.242    NA        NA      NA    
#> # ℹ 59 more rows
tidy(six_class_cm, by_class = FALSE)
#> # A tibble: 3 × 5
#>   term     estimate conf.low conf.high p.value
#>   <chr>       <dbl>    <dbl>     <dbl>   <dbl>
#> 1 accuracy   0.2       0.127     0.292   0.795
#> 2 kappa      0.0351   NA        NA      NA    
#> 3 mcnemar   NA        NA        NA       0.873
源代碼:R/caret-tidiers.R

相關用法


注:本文由純淨天空篩選整理自大神的英文原創作品 Tidy a(n) confusionMatrix object。非經特殊聲明,原始代碼版權歸原作者所有,本譯文未經允許或授權,請勿轉載或複製。