R coef.hclust “hclust”对象的凝聚/分裂系数

说明

计算 “agglomerative coefficient” (又名 diana 的 “divisive coefficient” )，测量数据集的聚类结构。

对于每个观测值 i，用 m(i) 表示其与其合并的第一个簇的不相似性，除以算法最后一步中合并的不相似性。凝聚系数是所有1 - m(i)的平均值。它也可以被视为横幅图的平均宽度(或填充百分比)。

coefHier() 直接与底层 C 代码接口，而 “proves” 只需要 object$heights 即可计算系数。

由于它随着观测数量的增加而增长，因此该度量不应用于比较大小差异很大的数据集。

用法

coefHier(object)
coef.hclust(object, ...)
## S3 method for class 'hclust'
coef(object, ...)
## S3 method for class 'twins'
coef(object, ...)

参数

object	类 "hclust" 或 "twins" 的对象，即通常是 hclust(.) 、 agnes(.) 或 diana(.) 的结果。 由于 coef.hclust 仅使用 object$heights 和 object$merge ，因此 object 可以是具有适当 merge 和 heights 组件的任何 list-like 对象。 对于coefHier，甚至只需要object$heights。
...	目前未使用的潜在进一步参数

值

指定由 Kaufman 和 Rousseeuw 定义的凝聚系数(或 diana 对象的除数)系数的数字，请参阅 agnes.object $ ac 或 diana.object $ dc 。

例子

data(agriculture)
aa <- agnes(agriculture)
coef(aa) # really just extracts aa$ac
coef(as.hclust(aa))# recomputes
coefHier(aa)       # ditto