R pltree 绘制层次聚类的聚类树

说明

pltree() 在当前图形设备上绘制聚类树(“dendrogram”)。我们提供 twins 方法绘制 twins 对象的树，即层次聚类，通常由 agnes() 或 diana() 产生。

用法

pltree(x, ...)
## S3 method for class 'twins'
pltree(x, main = paste("Dendrogram of ", deparse1(x$call)),
             labels = NULL, ylab = "Height", ...)

参数

x	一般来说，一个R对象，其中一个pltree方法已定义；具体来说，是一个类的对象"twins"，通常由以下任一者创建agnes()或者diana().
main	主标题具有合理的默认值。
labels	使用的标签；默认值由 x 构造。
ylab	y 轴的标签。
...	图形参数(请参阅 par )也可以作为该函数的参数提供。

细节

在给定 twins 对象的情况下创建聚类树图。树的叶子是原始的观察结果。在凝聚聚类的情况下，两个分支在合并的两个聚类之间的距离处聚集在一起。对于分裂聚类，分支在被分裂的簇的直径处分裂。

请注意，当前方法函数仅调用 plot(as.hclust(x), ...) ，它会分派到 plot.hclust(..) 。如果需要更灵活的绘图，请考虑 xx <- as.dendrogram(as.hclust(x)) 和绘图 xx ，请参阅 plot.dendrogram 。

值

返回 NULL 值。

例子

data(votes.repub)
agn <- agnes(votes.repub)
pltree(agn)

dagn  <- as.dendrogram(as.hclust(agn))
dagn2 <- as.dendrogram(as.hclust(agn), hang = 0.2)
op <- par(mar = par("mar") + c(0,0,0, 2)) # more space to the right
plot(dagn2, horiz = TRUE)
plot(dagn, horiz = TRUE, center = TRUE,
     nodePar = list(lab.cex = 0.6, lab.col = "forest green", pch = NA),
     main = deparse(agn$call))
par(op)

也可以看看

agnes , agnes.object , diana , diana.object , hclust , par , plot.agnes , plot.diana。