R pltree 繪製層次聚類的聚類樹

說明

pltree() 在當前圖形設備上繪製聚類樹(“dendrogram”)。我們提供 twins 方法繪製 twins 對象的樹，即層次聚類，通常由 agnes() 或 diana() 產生。

用法

pltree(x, ...)
## S3 method for class 'twins'
pltree(x, main = paste("Dendrogram of ", deparse1(x$call)),
             labels = NULL, ylab = "Height", ...)

參數

x	一般來說，一個R對象，其中一個pltree方法已定義；具體來說，是一個類的對象"twins"，通常由以下任一者創建agnes()或者diana().
main	主標題具有合理的默認值。
labels	使用的標簽；默認值由 x 構造。
ylab	y 軸的標簽。
...	圖形參數(請參閱 par )也可以作為該函數的參數提供。

細節

在給定 twins 對象的情況下創建聚類樹圖。樹的葉子是原始的觀察結果。在凝聚聚類的情況下，兩個分支在合並的兩個聚類之間的距離處聚集在一起。對於分裂聚類，分支在被分裂的簇的直徑處分裂。

請注意，當前方法函數僅調用 plot(as.hclust(x), ...) ，它會分派到 plot.hclust(..) 。如果需要更靈活的繪圖，請考慮 xx <- as.dendrogram(as.hclust(x)) 和繪圖 xx ，請參閱 plot.dendrogram 。

值

返回 NULL 值。

例子

data(votes.repub)
agn <- agnes(votes.repub)
pltree(agn)

dagn  <- as.dendrogram(as.hclust(agn))
dagn2 <- as.dendrogram(as.hclust(agn), hang = 0.2)
op <- par(mar = par("mar") + c(0,0,0, 2)) # more space to the right
plot(dagn2, horiz = TRUE)
plot(dagn, horiz = TRUE, center = TRUE,
     nodePar = list(lab.cex = 0.6, lab.col = "forest green", pch = NA),
     main = deparse(agn$call))
par(op)

也可以看看

agnes , agnes.object , diana , diana.object , hclust , par , plot.agnes , plot.diana。