Python SciPy hierarchy.maxRstat用法及代码示例

本文简要介绍 python 语言中 scipy.cluster.hierarchy.maxRstat 的用法。

用法:

scipy.cluster.hierarchy.maxRstat(Z, R, i)#

返回每个非单例集群及其子集群的最大统计量。

参数 ：：

Z： array_like

层次聚类编码为矩阵。有关详细信息，请参阅 linkage 。

R： array_like

不一致矩阵。

i： int

用作统计量的 R 列。

返回 ：：

MR： ndarray

计算不一致矩阵的第 i 列的最大统计量R对于每个非单例集群节点。MR[j]是最大超过R[Q(j)-n, i]，其中Q(j)与以下节点相对应的所有节点 ID 的集合，包括j.

例子：

>>> from scipy.cluster.hierarchy import median, inconsistent, maxRstat
>>> from scipy.spatial.distance import pdist

给定数据集 X ，我们可以应用聚类方法来获得链接矩阵 Z 。 scipy.cluster.hierarchy.inconsistent 也可用于获取与此聚类过程相关的不一致矩阵R：

>>> X = [[0, 0], [0, 1], [1, 0],
...      [0, 4], [0, 3], [1, 4],
...      [4, 0], [3, 0], [4, 1],
...      [4, 4], [3, 4], [4, 3]]

>>> Z = median(pdist(X))
>>> R = inconsistent(Z)
>>> R
array([[1.        , 0.        , 1.        , 0.        ],
       [1.        , 0.        , 1.        , 0.        ],
       [1.        , 0.        , 1.        , 0.        ],
       [1.        , 0.        , 1.        , 0.        ],
       [1.05901699, 0.08346263, 2.        , 0.70710678],
       [1.05901699, 0.08346263, 2.        , 0.70710678],
       [1.05901699, 0.08346263, 2.        , 0.70710678],
       [1.05901699, 0.08346263, 2.        , 0.70710678],
       [1.74535599, 1.08655358, 3.        , 1.15470054],
       [1.91202266, 1.37522872, 3.        , 1.15470054],
       [3.25      , 0.25      , 3.        , 0.        ]])

scipy.cluster.hierarchy.maxRstat 可用于计算每个非单例集群及其子集群的 R 每列的最大值：

>>> maxRstat(Z, R, 0)
array([1.        , 1.        , 1.        , 1.        , 1.05901699,
       1.05901699, 1.05901699, 1.05901699, 1.74535599, 1.91202266,
       3.25      ])
>>> maxRstat(Z, R, 1)
array([0.        , 0.        , 0.        , 0.        , 0.08346263,
       0.08346263, 0.08346263, 0.08346263, 1.08655358, 1.37522872,
       1.37522872])
>>> maxRstat(Z, R, 3)
array([0.        , 0.        , 0.        , 0.        , 0.70710678,
       0.70710678, 0.70710678, 0.70710678, 1.15470054, 1.15470054,
       1.15470054])