本文整理汇总了Python中biom.Table.subsample方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Table.subsample方法的具体用法？Python Table.subsample怎么用？Python Table.subsample使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类biom.Table的用法示例。
在下文中一共展示了Table.subsample方法的2个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: rarefy
# 需要导入模块: from biom import Table [as 别名]
# 或者: from biom.Table import subsample [as 别名]
def rarefy(table: biom.Table, sampling_depth: int) -> biom.Table:
table = table.subsample(sampling_depth, axis='sample', by_id=False)
if table.is_empty():
raise ValueError('The rarefied table contains no samples or features. '
'Verify your table is valid and that you provided a '
'shallow enough sampling depth.')
return table示例2: rarefy
# 需要导入模块: from biom import Table [as 别名]
# 或者: from biom.Table import subsample [as 别名]
def rarefy(table: biom.Table, sampling_depth: int) -> biom.Table:
return table.subsample(sampling_depth, axis='sample', by_id=False)