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Python TabFile.write方法代码示例

本文整理汇总了Python中bcftbx.TabFile.write方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python TabFile.write方法的具体用法?Python TabFile.write怎么用?Python TabFile.write使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在bcftbx.TabFile的用法示例。


在下文中一共展示了TabFile.write方法的3个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: test_write_data

# 需要导入模块: from bcftbx import TabFile [as 别名]
# 或者: from bcftbx.TabFile import write [as 别名]
 def test_write_data(self):
     """Write data to file-like object
     """
     tabfile = TabFile('test',self.fp)
     fp = cStringIO.StringIO()
     tabfile.write(fp=fp)
     self.assertEqual(fp.getvalue(),self.data)
     fp.close()
开发者ID:marcelcaraciolo,项目名称:genomics,代码行数:10,代码来源:test_TabFile.py

示例2: test_write_data_with_header

# 需要导入模块: from bcftbx import TabFile [as 别名]
# 或者: from bcftbx.TabFile import write [as 别名]
 def test_write_data_with_header(self):
     """Write data to file-like object including a header line
     """
     tabfile = TabFile('test',self.fp,first_line_is_header=True,delimiter=',')
     fp = cStringIO.StringIO()
     tabfile.write(fp=fp,include_header=True)
     self.assertEqual(fp.getvalue(),self.header.replace('\t',',')+self.data.replace('\t',','))
     fp.close()
开发者ID:marcelcaraciolo,项目名称:genomics,代码行数:10,代码来源:test_TabFile.py

示例3: test_change_delimiter_for_write

# 需要导入模块: from bcftbx import TabFile [as 别名]
# 或者: from bcftbx.TabFile import write [as 别名]
 def test_change_delimiter_for_write(self):
     """Write data out with different delimiter to input
     """
     tabfile = TabFile('test',self.fp,delimiter=',')
     # Modified delimiter (tab)
     fp = cStringIO.StringIO()
     tabfile.write(fp=fp,delimiter='\t')
     self.assertEqual(fp.getvalue(),self.data)
     fp.close()
     # Default (should revert to comma)
     fp = cStringIO.StringIO()
     tabfile.write(fp=fp)
     self.assertEqual(fp.getvalue(),self.data.replace('\t',','))
     fp.close()
开发者ID:marcelcaraciolo,项目名称:genomics,代码行数:16,代码来源:test_TabFile.py


注:本文中的bcftbx.TabFile.write方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。