本文整理汇总了Python中bcftbx.TabFile.write方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python TabFile.write方法的具体用法?Python TabFile.write怎么用?Python TabFile.write使用的例子?那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类bcftbx.TabFile
的用法示例。
在下文中一共展示了TabFile.write方法的3个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_write_data
# 需要导入模块: from bcftbx import TabFile [as 别名]
# 或者: from bcftbx.TabFile import write [as 别名]
def test_write_data(self):
"""Write data to file-like object
"""
tabfile = TabFile('test',self.fp)
fp = cStringIO.StringIO()
tabfile.write(fp=fp)
self.assertEqual(fp.getvalue(),self.data)
fp.close()
示例2: test_write_data_with_header
# 需要导入模块: from bcftbx import TabFile [as 别名]
# 或者: from bcftbx.TabFile import write [as 别名]
def test_write_data_with_header(self):
"""Write data to file-like object including a header line
"""
tabfile = TabFile('test',self.fp,first_line_is_header=True,delimiter=',')
fp = cStringIO.StringIO()
tabfile.write(fp=fp,include_header=True)
self.assertEqual(fp.getvalue(),self.header.replace('\t',',')+self.data.replace('\t',','))
fp.close()
示例3: test_change_delimiter_for_write
# 需要导入模块: from bcftbx import TabFile [as 别名]
# 或者: from bcftbx.TabFile import write [as 别名]
def test_change_delimiter_for_write(self):
"""Write data out with different delimiter to input
"""
tabfile = TabFile('test',self.fp,delimiter=',')
# Modified delimiter (tab)
fp = cStringIO.StringIO()
tabfile.write(fp=fp,delimiter='\t')
self.assertEqual(fp.getvalue(),self.data)
fp.close()
# Default (should revert to comma)
fp = cStringIO.StringIO()
tabfile.write(fp=fp)
self.assertEqual(fp.getvalue(),self.data.replace('\t',','))
fp.close()