本文整理汇总了Python中bcftbx.TabFile.insert方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python TabFile.insert方法的具体用法？Python TabFile.insert怎么用？Python TabFile.insert使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类bcftbx.TabFile的用法示例。
在下文中一共展示了TabFile.insert方法的4个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_insert_tab_data_line
# 需要导入模块: from bcftbx import TabFile [as 别名]
# 或者: from bcftbx.TabFile import insert [as 别名]
def test_insert_tab_data_line(self):
"""Insert a TabDataLine into a TabFile
"""
tabfile = TabFile('test',self.fp)
self.assertEqual(len(tabfile),3)
tabdataline = TabDataLine('chr1\t10000\t20000\t+')
line = tabfile.insert(2,tabdataline=tabdataline)
self.assertEqual(len(tabfile),4)
# Check new line is correct
self.assertTrue(line is tabdataline)示例2: test_insert_line_with_tab_data
# 需要导入模块: from bcftbx import TabFile [as 别名]
# 或者: from bcftbx.TabFile import insert [as 别名]
def test_insert_line_with_tab_data(self):
"""Insert line into a TabFile populated from tabbed data
"""
data = 'chr1\t10000\t20000\t+'
tabfile = TabFile('test',self.fp)
self.assertEqual(len(tabfile),3)
line = tabfile.insert(2,tabdata=data)
self.assertEqual(len(tabfile),4)
# Check new line is correct
self.assertTrue(str(line) == data)示例3: test_insert_empty_line
# 需要导入模块: from bcftbx import TabFile [as 别名]
# 或者: from bcftbx.TabFile import insert [as 别名]
def test_insert_empty_line(self):
"""Insert a blank line into a TabFile
"""
tabfile = TabFile('test',self.fp)
self.assertEqual(len(tabfile),3)
line = tabfile.insert(2)
self.assertEqual(len(tabfile),4)
# Check new line is empty
for i in range(len(line)):
self.assertTrue(str(line[i]) == '')示例4: test_insert_line_with_data
# 需要导入模块: from bcftbx import TabFile [as 别名]
# 或者: from bcftbx.TabFile import insert [as 别名]
def test_insert_line_with_data(self):
"""Insert line into a TabFile populated with data
"""
data = ['chr1',678,901,6.1]
tabfile = TabFile('test',self.fp)
self.assertEqual(len(tabfile),3)
line = tabfile.insert(2,data=data)
self.assertEqual(len(tabfile),4)
# Check new line is correct
for i in range(len(data)):
self.assertTrue(line[i] == data[i])