本文整理汇总了Python中bcftbx.TabFile.lookup方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python TabFile.lookup方法的具体用法？Python TabFile.lookup怎么用？Python TabFile.lookup使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类bcftbx.TabFile的用法示例。
在下文中一共展示了TabFile.lookup方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_lookup
# 需要导入模块: from bcftbx import TabFile [as 别名]
# 或者: from bcftbx.TabFile import lookup [as 别名]
def test_lookup(self):
"""Look up data from a TabFile
"""
tabfile = TabFile('test',self.fp,first_line_is_header=True)
# Look for lines with 'chr1' in the chr column
matching = tabfile.lookup('chr','chr1')
self.assertEqual(len(matching),2)
for m in matching:
self.assertEqual(m['chr'],'chr1',"Lookup returned bad match: '%s'" % m)
self.assertNotEqual(matching[0],matching[1])
# Look for lines with 'chr2' in the chr column
matching = tabfile.lookup('chr','chr2')
self.assertEqual(len(matching),1)
self.assertEqual(matching[0]['chr'],'chr2',"Lookup returned bad match: '%s'" % m)
# Look for lines with 'bananas' in the chr column
self.assertEqual(len(tabfile.lookup('chr','bananas')),0)