本文整理汇总了Python中bcftbx.TabFile.transformColumn方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python TabFile.transformColumn方法的具体用法？Python TabFile.transformColumn怎么用？Python TabFile.transformColumn使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类bcftbx.TabFile的用法示例。
在下文中一共展示了TabFile.transformColumn方法的2个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_apply_operation_to_column
# 需要导入模块: from bcftbx import TabFile [as 别名]
# 或者: from bcftbx.TabFile import transformColumn [as 别名]
def test_apply_operation_to_column(self):
"""Divide values in a column by 10
"""
tabfile = TabFile('test',self.fp,first_line_is_header=True)
# Check number of columns and header items
self.assertEqual(tabfile.nColumns(),4)
self.assertEqual(tabfile.header(),['chr','start','end','data'])
# Divide data column by 10
tabfile.transformColumn('data',lambda x: x/10)
results = [0.46,0.57,0.68]
for i in range(len(tabfile)):
self.assertEqual(tabfile[i]['data'],results[i])示例2: test_set_column_to_constant_value
# 需要导入模块: from bcftbx import TabFile [as 别名]
# 或者: from bcftbx.TabFile import transformColumn [as 别名]
def test_set_column_to_constant_value(self):
"""Set a column to a constant value using transformColumn
"""
tabfile = TabFile('test',self.fp,first_line_is_header=True)
# Check number of columns and header items
self.assertEqual(tabfile.nColumns(),4)
self.assertEqual(tabfile.header(),['chr','start','end','data'])
# Add a strand column
tabfile.appendColumn('strand')
self.assertEqual(tabfile.nColumns(),5)
self.assertEqual(tabfile.header(),['chr','start','end','data','strand'])
# Set all values to '+'
tabfile.transformColumn('strand',lambda x: '+')
for line in tabfile:
self.assertEqual(line['strand'],'+')