本文整理汇总了Python中bcftbx.TabFile.appendColumn方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python TabFile.appendColumn方法的具体用法？Python TabFile.appendColumn怎么用？Python TabFile.appendColumn使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类bcftbx.TabFile的用法示例。
在下文中一共展示了TabFile.appendColumn方法的2个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_append_column
# 需要导入模块: from bcftbx import TabFile [as 别名]
# 或者: from bcftbx.TabFile import appendColumn [as 别名]
def test_append_column(self):
"""Append new column to a Tabfile
"""
tabfile = TabFile('test',self.fp,first_line_is_header=True)
self.assertEqual(len(tabfile.header()),4)
tabfile.appendColumn('new')
self.assertEqual(len(tabfile.header()),5)
self.assertEqual(tabfile.header()[4],'new')
self.assertEqual(tabfile[0]['new'],'')示例2: test_set_column_to_constant_value
# 需要导入模块: from bcftbx import TabFile [as 别名]
# 或者: from bcftbx.TabFile import appendColumn [as 别名]
def test_set_column_to_constant_value(self):
"""Set a column to a constant value using transformColumn
"""
tabfile = TabFile('test',self.fp,first_line_is_header=True)
# Check number of columns and header items
self.assertEqual(tabfile.nColumns(),4)
self.assertEqual(tabfile.header(),['chr','start','end','data'])
# Add a strand column
tabfile.appendColumn('strand')
self.assertEqual(tabfile.nColumns(),5)
self.assertEqual(tabfile.header(),['chr','start','end','data','strand'])
# Set all values to '+'
tabfile.transformColumn('strand',lambda x: '+')
for line in tabfile:
self.assertEqual(line['strand'],'+')