本文整理汇总了Python中bcftbx.TabFile.reorderColumns方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python TabFile.reorderColumns方法的具体用法？Python TabFile.reorderColumns怎么用？Python TabFile.reorderColumns使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类bcftbx.TabFile的用法示例。
在下文中一共展示了TabFile.reorderColumns方法的2个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: test_reorder_columns
# 需要导入模块: from bcftbx import TabFile [as 别名]
# 或者: from bcftbx.TabFile import reorderColumns [as 别名]
def test_reorder_columns(self):
"""Reorder columns in a TabFile
"""
tabfile = TabFile('test',self.fp,first_line_is_header=True)
# Check number of columns and header items
self.assertEqual(tabfile.nColumns(),4)
self.assertEqual(tabfile.header(),['chr','start','end','data'])
# Reorder
new_columns = ['chr','data','start','end']
tabfile = tabfile.reorderColumns(new_columns)
self.assertEqual(tabfile.nColumns(),4)
self.assertEqual(tabfile.header(),new_columns)
self.assertEqual(str(tabfile[0]),"chr1\t4.6\t1\t234")
self.assertEqual(str(tabfile[1]),"chr1\t5.7\t567\t890")
self.assertEqual(str(tabfile[2]),"chr2\t6.8\t1234\t5678")示例2: test_reorder_columns_empty_cells
# 需要导入模块: from bcftbx import TabFile [as 别名]
# 或者: from bcftbx.TabFile import reorderColumns [as 别名]
def test_reorder_columns_empty_cells(self):
"""Reorder columns where some lines have empty cells at the start
"""
tabfile = TabFile('test',self.fp,first_line_is_header=True)
# Check number of columns and header items
self.assertEqual(tabfile.nColumns(),4)
self.assertEqual(tabfile.header(),['chr','start','end','data'])
# Reset some cells to empty
tabfile[0]['chr'] = ''
tabfile[2]['chr'] = ''
# Reorder
new_columns = ['chr','data','start','end']
tabfile = tabfile.reorderColumns(new_columns)
self.assertEqual(tabfile.nColumns(),4)
self.assertEqual(tabfile.header(),new_columns)
self.assertEqual(str(tabfile[0]),"\t4.6\t1\t234")
self.assertEqual(str(tabfile[1]),"chr1\t5.7\t567\t890")
self.assertEqual(str(tabfile[2]),"\t6.8\t1234\t5678")