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Python PDBModel.sort方法代码示例

本文整理汇总了Python中Biskit.PDBModel.sort方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python PDBModel.sort方法的具体用法?Python PDBModel.sort怎么用?Python PDBModel.sort使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Biskit.PDBModel的用法示例。


在下文中一共展示了PDBModel.sort方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: errWriteln

# 需要导入模块: from Biskit import PDBModel [as 别名]
# 或者: from Biskit.PDBModel import sort [as 别名]
    errWriteln("loading pdbs...")
    
    m1 = PDBModel( f1 )
    m2 = PDBModel( f2 )

    if options.has_key('c1'):
        m1 = m1.takeChains( toIntList( options['c1'] ) )

    if options.has_key('c2'):
        m2 = m2.takeChains( toIntList( options['c2'] ) )

    m1.removeRes( 'TIP3' )
    m2.removeRes( 'TIP3' )

    m1.sort()
    m2.sort()

    errWriteln("compare atoms of pdbs...")
    mask1, mask2 = m1.equalAtoms( m2 )

    errWriteln("removing %i atoms from %s" % (sum( logical_not( mask1 ) ), f1))
    m1.remove( logical_not( mask1 ) )
    
    errWriteln("removing %i atoms from %s" % (sum( logical_not( mask2 ) ), f2))
    m2.remove( logical_not( mask2 ) )

    errWriteln("writing new pdbs..." )
    m1.writePdb( o1 )
    m2.writePdb( o2 )
开发者ID:ostrokach,项目名称:biskit,代码行数:31,代码来源:castPdbs.py


注:本文中的Biskit.PDBModel.sort方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。