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Python PDBModel.maskH2O方法代码示例

本文整理汇总了Python中Biskit.PDBModel.maskH2O方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python PDBModel.maskH2O方法的具体用法?Python PDBModel.maskH2O怎么用?Python PDBModel.maskH2O使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Biskit.PDBModel的用法示例。


在下文中一共展示了PDBModel.maskH2O方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: parseReference

# 需要导入模块: from Biskit import PDBModel [as 别名]
# 或者: from Biskit.PDBModel import maskH2O [as 别名]
    def parseReference(self, fpdb, dry_out=None ):
        flushPrint("parsing "+fpdb+"...")
        m = PDBModel( fpdb )
        
        solute_res = m.atom2resMask( logical_not( m.maskSolvent() )  )
        self.lenres = self.lenres or sum( solute_res )
        self.lenatoms = len( m ) - sum( m.maskH2O() )

        if dry_out:
            m.remove( m.maskH2O() )
            m.writePdb( dry_out )
        flushPrint('done.\n')
开发者ID:ostrokach,项目名称:biskit,代码行数:14,代码来源:amber_ensembleMD.py


注:本文中的Biskit.PDBModel.maskH2O方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。