本文整理汇总了Python中Biskit.PDBModel.maskH2O方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python PDBModel.maskH2O方法的具体用法?Python PDBModel.maskH2O怎么用?Python PDBModel.maskH2O使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Biskit.PDBModel
的用法示例。
在下文中一共展示了PDBModel.maskH2O方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: parseReference
# 需要导入模块: from Biskit import PDBModel [as 别名]
# 或者: from Biskit.PDBModel import maskH2O [as 别名]
def parseReference(self, fpdb, dry_out=None ):
flushPrint("parsing "+fpdb+"...")
m = PDBModel( fpdb )
solute_res = m.atom2resMask( logical_not( m.maskSolvent() ) )
self.lenres = self.lenres or sum( solute_res )
self.lenatoms = len( m ) - sum( m.maskH2O() )
if dry_out:
m.remove( m.maskH2O() )
m.writePdb( dry_out )
flushPrint('done.\n')