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Python PDBModel.lenAtoms方法代码示例

本文整理汇总了Python中Biskit.PDBModel.lenAtoms方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python PDBModel.lenAtoms方法的具体用法?Python PDBModel.lenAtoms怎么用?Python PDBModel.lenAtoms使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在Biskit.PDBModel的用法示例。


在下文中一共展示了PDBModel.lenAtoms方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。

示例1: Test

# 需要导入模块: from Biskit import PDBModel [as 别名]
# 或者: from Biskit.PDBModel import lenAtoms [as 别名]
class Test(BT.BiskitTest):
    """Test case"""

    def test_surfaceRacerTools(self):
        """surfaceRacerTools test"""
        from Biskit import PDBModel
        import Biskit.tools as T
        
        ## load a structure
        self.m = PDBModel( T.testRoot()+'/lig/1A19.pdb' )
        self.m = self.m.compress( self.m.maskProtein() )
        self.m = self.m.compress( self.m.maskHeavy() )
        
        ## some fake surface data
        surf = Numeric.ones( self.m.lenAtoms()) * 10.0

        relExp = relExposure( self.m, surf )
        
##         if self.local:
##             globals().update( locals() )
            
        self.assertEqual( Numeric.sum(relExp), 44276.860852223857 )
开发者ID:ostrokach,项目名称:biskit,代码行数:24,代码来源:surfaceRacerTools.py


注:本文中的Biskit.PDBModel.lenAtoms方法示例由纯净天空整理自Github/MSDocs等开源代码及文档管理平台,相关代码片段筛选自各路编程大神贡献的开源项目,源码版权归原作者所有,传播和使用请参考对应项目的License;未经允许,请勿转载。