本文整理汇总了Python中Biskit.PDBModel.lenAtoms方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题:Python PDBModel.lenAtoms方法的具体用法?Python PDBModel.lenAtoms怎么用?Python PDBModel.lenAtoms使用的例子?那么, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Biskit.PDBModel
的用法示例。
在下文中一共展示了PDBModel.lenAtoms方法的1个代码示例,这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞,您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: Test
# 需要导入模块: from Biskit import PDBModel [as 别名]
# 或者: from Biskit.PDBModel import lenAtoms [as 别名]
class Test(BT.BiskitTest):
"""Test case"""
def test_surfaceRacerTools(self):
"""surfaceRacerTools test"""
from Biskit import PDBModel
import Biskit.tools as T
## load a structure
self.m = PDBModel( T.testRoot()+'/lig/1A19.pdb' )
self.m = self.m.compress( self.m.maskProtein() )
self.m = self.m.compress( self.m.maskHeavy() )
## some fake surface data
surf = Numeric.ones( self.m.lenAtoms()) * 10.0
relExp = relExposure( self.m, surf )
## if self.local:
## globals().update( locals() )
self.assertEqual( Numeric.sum(relExp), 44276.860852223857 )