本文整理汇总了Python中Biskit.PDBModel.equalAtoms方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python PDBModel.equalAtoms方法的具体用法？Python PDBModel.equalAtoms怎么用？Python PDBModel.equalAtoms使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Biskit.PDBModel的用法示例。
在下文中一共展示了PDBModel.equalAtoms方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: errWriteln
# 需要导入模块: from Biskit import PDBModel [as 别名]
# 或者: from Biskit.PDBModel import equalAtoms [as 别名]
errWriteln("loading pdbs...")
m1 = PDBModel( f1 )
m2 = PDBModel( f2 )
if options.has_key('c1'):
m1 = m1.takeChains( toIntList( options['c1'] ) )
if options.has_key('c2'):
m2 = m2.takeChains( toIntList( options['c2'] ) )
m1.removeRes( 'TIP3' )
m2.removeRes( 'TIP3' )
m1.sort()
m2.sort()
errWriteln("compare atoms of pdbs...")
mask1, mask2 = m1.equalAtoms( m2 )
errWriteln("removing %i atoms from %s" % (sum( logical_not( mask1 ) ), f1))
m1.remove( logical_not( mask1 ) )
errWriteln("removing %i atoms from %s" % (sum( logical_not( mask2 ) ), f2))
m2.remove( logical_not( mask2 ) )
errWriteln("writing new pdbs..." )
m1.writePdb( o1 )
m2.writePdb( o2 )