本文整理汇总了Python中Input.readZMatrix方法的典型用法代码示例。如果您正苦于以下问题：Python Input.readZMatrix方法的具体用法？Python Input.readZMatrix怎么用？Python Input.readZMatrix使用的例子？那么恭喜您, 这里精选的方法代码示例或许可以为您提供帮助。您也可以进一步了解该方法所在类Input的用法示例。
在下文中一共展示了Input.readZMatrix方法的1个代码示例，这些例子默认根据受欢迎程度排序。您可以为喜欢或者感觉有用的代码点赞，您的评价将有助于系统推荐出更棒的Python代码示例。
示例1: getInputZMatrix
# 需要导入模块: import Input [as 别名]
# 或者: from Input import readZMatrix [as 别名]
def getInputZMatrix(self):
try:
data_section = re.compile("INPUT CARD.*?DATA(.*?)END", re.DOTALL).search(self.fileText).groups()[0]
xyz = self.getInitialXYZ()
atom_list = []
for atom in xyz: atom_list.append(atom[0])
#build the regular expression
regExp = []
for atom in atom_list:
regExp.append( r" INPUT CARD>(%s.*?)\n" % atom )
regExp = "".join(regExp)
zmat_tuple = re.compile(regExp).search(data_section).groups()
#convert the zmat_lines into a list
zmat_lines = []
for entry in zmat_tuple: zmat_lines.append(entry)
#now get anything that would be z matrix variable
zmat_lines.append("Variables")
regExp = "[A-Z\d]+\s*[=]\s*[-]?\d+[.]?\d*"
vars = re.compile(regExp).findall(data_section)
for var in vars:
zmat_lines.append(var)
zmat_text = "\n".join(zmat_lines)
import Input
atomList, zmatObject = Input.readZMatrix(zmat_text)
return zmatObject
except Exception, error:
raise InfoNotFoundError("Z-Matrix")