R broom tidy.Mclust 整理 a(n) Mclust 對象

Tidy 總結了有關模型組件的信息。模型組件可能是回歸中的單個項、單個假設、聚類或類。 tidy 所認為的模型組件的確切含義因模型而異，但通常是不言而喻的。如果模型具有多種不同類型的組件，您將需要指定要返回哪些組件。

用法

# S3 method for Mclust
tidy(x, ...)

參數

x

從 mclust::Mclust() 返回 Mclust 對象。

...

附加參數。不曾用過。僅需要匹配通用簽名。注意：拚寫錯誤的參數將被吸收到 ... 中，並被忽略。如果拚寫錯誤的參數有默認值，則將使用默認值。例如，如果您傳遞 conf.lvel = 0.9 ，所有計算將使用 conf.level = 0.95 進行。這裏有兩個異常：

tidy() 方法在提供 exponentiate 參數時會發出警告(如果該參數將被忽略)。
augment() 方法在提供 newdata 參數時會發出警告(如果該參數將被忽略)。

也可以看看

tidy() , mclust::Mclust()

其他 mclust 整理器：augment.Mclust()

值

帶有列的 tibble::tibble()：

proportion: 各組分混合比例
size: 分配給簇的點數。
mean: 每個分量的平均值。對於 2+ 維模型，將為每個維度添加一個包含平均值的列。噪聲分量的 NA
variance: 對於一維和球形模型，每個分量的方差，否則省略。噪聲分量的 NA
component: 集群 ID 作為一個因子。

例子


# load library for models and data
library(mclust)

# load data manipulation libraries
library(dplyr)
library(tibble)
library(purrr)
library(tidyr)

set.seed(27)

centers <- tibble(
  cluster = factor(1:3),
  # number points in each cluster
  num_points = c(100, 150, 50),
  # x1 coordinate of cluster center
  x1 = c(5, 0, -3),
  # x2 coordinate of cluster center
  x2 = c(-1, 1, -2)
)

points <- centers %>%
  mutate(
    x1 = map2(num_points, x1, rnorm),
    x2 = map2(num_points, x2, rnorm)
  ) %>%
  select(-num_points, -cluster) %>%
  unnest(c(x1, x2))

# fit model
m <- Mclust(points)

# summarize model fit with tidiers
tidy(m)
#> # A tibble: 3 × 6
#>   component  size proportion variance mean.x1 mean.x2
#>       <int> <int>      <dbl>    <dbl>   <dbl>   <dbl>
#> 1         1   101      0.335     1.12  5.01     -1.04
#> 2         2   150      0.503     1.12  0.0594    1.00
#> 3         3    49      0.161     1.12 -3.20     -2.06
augment(m, points)
#> # A tibble: 300 × 4
#>       x1     x2 .class .uncertainty
#>    <dbl>  <dbl> <fct>         <dbl>
#>  1  6.91 -2.74  1          3.98e-11
#>  2  6.14 -2.45  1          1.99e- 9
#>  3  4.24 -0.946 1          1.47e- 4
#>  4  3.54  0.287 1          2.94e- 2
#>  5  3.91  0.408 1          7.48e- 3
#>  6  5.30 -1.58  1          4.22e- 7
#>  7  5.01 -1.77  1          1.06e- 6
#>  8  6.16 -1.68  1          7.64e- 9
#>  9  7.13 -2.17  1          4.16e-11
#> 10  5.24 -2.42  1          1.16e- 7
#> # ℹ 290 more rows
glance(m)
#> # A tibble: 1 × 7
#>   model     G    BIC logLik    df hypvol  nobs
#>   <chr> <int>  <dbl>  <dbl> <dbl>  <dbl> <int>
#> 1 EII       3 -2402. -1175.     9     NA   300

源代碼：R/mclust-tidiers.R

相關用法

注：本文由純淨天空篩選整理自等大神的英文原創作品 Tidy a(n) Mclust object。非經特殊聲明，原始代碼版權歸原作者所有，本譯文未經允許或授權，請勿轉載或複製。