R reorder.dendrogram 重新排序樹狀圖

說明

通用函數 reorder 的方法。

樹狀圖有許多不同的排序，它們與所施加的結構一致。該函數采用樹狀圖和值向量，並按照提供的向量的順序對樹狀圖重新排序，從而保持對樹狀圖的約束。

用法

## S3 method for class 'dendrogram'
reorder(x, wts, agglo.FUN = sum, ...)

參數

x	要重新排序的(樹狀圖)對象
wts	用於重新排序的數字權重(任意值)。
agglo.FUN	權重聚合函數，見下文。
...	附加論點

細節

使用權重 wts ，對樹狀圖的葉子進行重新排序，以便其順序盡可能與權重一致。在每個節點，分支按權重遞增的方式排序，其中分支的權重定義為f(w_j)，其中f 是agglo.FUN，w_j 是第j 子分支的權重。

值

樹狀圖，其中每個節點都有一個進一步的屬性value及其相應的權重。

例子

require(graphics)

set.seed(123)
x <- rnorm(10)
hc <- hclust(dist(x))
dd <- as.dendrogram(hc)
dd.reorder <- reorder(dd, 10:1)
plot(dd, main = "random dendrogram 'dd'")

op <- par(mfcol = 1:2)
plot(dd.reorder, main = "reorder(dd, 10:1)")
plot(reorder(dd, 10:1, agglo.FUN = mean), main = "reorder(dd, 10:1, mean)")
par(op)

作者

R. Gentleman and M. Maechler

也可以看看

reorder 。

rev.dendrogram 隻是顛倒節點的順序； heatmap、cophenetic。