R reorder.dendrogram 重新排序树状图

说明

通用函数 reorder 的方法。

树状图有许多不同的排序，它们与所施加的结构一致。该函数采用树状图和值向量，并按照提供的向量的顺序对树状图重新排序，从而保持对树状图的约束。

用法

## S3 method for class 'dendrogram'
reorder(x, wts, agglo.FUN = sum, ...)

参数

x	要重新排序的(树状图)对象
wts	用于重新排序的数字权重(任意值)。
agglo.FUN	权重聚合函数，见下文。
...	附加论点

细节

使用权重 wts ，对树状图的叶子进行重新排序，以便其顺序尽可能与权重一致。在每个节点，分支按权重递增的方式排序，其中分支的权重定义为f(w_j)，其中f 是agglo.FUN，w_j 是第j 子分支的权重。

值

树状图，其中每个节点都有一个进一步的属性value及其相应的权重。

例子

require(graphics)

set.seed(123)
x <- rnorm(10)
hc <- hclust(dist(x))
dd <- as.dendrogram(hc)
dd.reorder <- reorder(dd, 10:1)
plot(dd, main = "random dendrogram 'dd'")

op <- par(mfcol = 1:2)
plot(dd.reorder, main = "reorder(dd, 10:1)")
plot(reorder(dd, 10:1, agglo.FUN = mean), main = "reorder(dd, 10:1, mean)")
par(op)

作者

R. Gentleman and M. Maechler

也可以看看

reorder 。

rev.dendrogram 只是颠倒节点的顺序； heatmap、cophenetic。