R nlmeControl nlme Fit 的控制值

R语言 nlmeControl 位于 nlme 包(package)。

说明

函数调用中提供的值替换默认值，并返回包含所有可能参数的列表。返回的列表用作nlme 函数的control 参数。

用法

nlmeControl(maxIter, pnlsMaxIter, msMaxIter, minScale,
            tolerance, niterEM, pnlsTol, msTol,
            returnObject, msVerbose, msWarnNoConv,
            gradHess, apVar, .relStep, minAbsParApVar = 0.05,
            opt = c("nlminb", "nlm"), natural = TRUE, sigma = NULL, ...)

参数

`maxIter`	`nlme` 优化算法的最大迭代次数。默认值为 50。
`pnlsMaxIter`	`nlme` 优化中 `PNLS` 优化步骤的最大迭代次数。默认值为 7。
`msMaxIter`	`nlme` 优化内的 `nlminb` ( `iter.max` ) 或 `nlm` ( `iterlim` ，从第 10 步开始) 优化步骤的最大迭代次数。默认值为 50(对于过度参数化的情况等可能太小)。
`minScale`	缩小默认步长大小以尝试减少 `PNLS` 步骤中的平方和的最小因子。默认`0.001`。
`tolerance`	`nlme` 算法中收敛标准的容差。默认为 `1e-6` 。
`niterEM`	用于细化随机效应方差-协方差系数的初始估计的 EM 算法的迭代次数。默认值为 25。
`pnlsTol`	`PNLS` 步骤中收敛标准的容差。默认为 `1e-3` 。
`msTol`	`nlm` 中收敛标准的容差，作为 `gradtol` 参数传递给函数(请参阅 `nlm` 文档)。默认为 `1e-7` 。
`returnObject`	一个逻辑值，指示当达到最大迭代次数且算法不收敛时是否应返回拟合对象。默认为 `FALSE` 。
`msVerbose`	作为 `trace` 传递到 `nlminb(.., control= list(trace = *, ..))` 或作为参数 `print.level` 传递到 `nlm()` 的逻辑值。默认为 `FALSE` 。
`msWarnNoConv`	逻辑指示每当 LME 步骤中的最小化(通过 `opt` )不收敛时是否应发出 `warning` 信号；默认为 `TRUE` 。
`gradHess`	一个逻辑值，指示对数似然函数的数值梯度向量和 Hessian 矩阵是否应在 `nlm` 优化中使用。仅当相关结构 ( `corStruct` ) 和方差函数结构 ( `varFunc` ) 没有 "varying" 参数且随机效应结构中使用的 `pdMat` 类为 `pdSymm`(一般正-定)、`pdDiag`(对角线)、`pdIdent`(恒等式的倍数)或`pdCompSymm`(复合对称)。默认为 `TRUE` 。
`apVar`	一个逻辑值，指示是否应计算方差-协方差参数的近似协方差矩阵。默认为 `TRUE` 。
`.relStep`	数值导数计算的相对步骤。默认为 `.Machine$double.eps^(1/3)` 。
`minAbsParApVar`	数值 - 近似方差计算中的最小绝对参数值。默认为 `0.05` 。
`opt`	要使用的优化器， `"nlminb"` (默认)或 `"nlm"` 。
`natural`	一个逻辑值，指示在计算估计量的近似协方差矩阵时，是否应将 `pdNatural` 参数化用于 `reStruct` 中的一般正定矩阵 (`pdSymm` )。默认为 `TRUE` 。
`sigma`	可选用正数来固定残差。如果默认情况下 `NULL` 或 `0` ，则估计 sigma。
`...`	此外，命名控制参数将传递给`nlminb`(除了上面提到的`trace`和`iter.max`)，在使用的地方(`eval.max`和`abs.tol`以下)。

值

包含每个可能参数的组件的列表。

例子

# decrease the maximum number of iterations and request tracing
nlmeControl(msMaxIter = 20, msVerbose = TRUE)

作者

José Pinheiro and Douglas Bates bates@stat.wisc.edu; the sigma option: Siem Heisterkamp and Bert van Willigen.

也可以看看

nlme , nlm , optim , nlmeStruct

相关用法

注：本文由纯净天空筛选整理自R-devel大神的英文原创作品 Control Values for nlme Fit。非经特殊声明，原始代码版权归原作者所有，本译文未经允许或授权，请勿转载或复制。